Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCX5

Neurl4, Neuralized-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl4Q5NCX5 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Neurl4Q5NCX5 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Neurl4Q5NCX5 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Neurl4Q5NCX5 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Neurl4Q5NCX5 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Neurl4Q5NCX5 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Neurl4Q5NCX5 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Neurl4Q5NCX5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Neurl4Q5NCX5 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Neurl4Q5NCX5 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Neurl4Q5NCX5 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Neurl4Q5NCX5 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Neurl4Q5NCX5 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Neurl4Q5NCX5 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Neurl4Q5NCX5 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Neurl4Q5NCX5 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Neurl4Q5NCX5 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Neurl4Q5NCX5 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Neurl4Q5NCX5 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Neurl4Q5NCX5 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Neurl4Q5NCX5 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Neurl4Q5NCX5 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Neurl4Q5NCX5 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Neurl4Q5NCX5 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Neurl4Q5NCX5 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Neurl4Q5NCX5 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Neurl4Q5NCX5 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Neurl4Q5NCX5 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Neurl4Q5NCX5 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Neurl4Q5NCX5 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Neurl4Q5NCX5 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Neurl4Q5NCX5 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Neurl4Q5NCX5 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Neurl4Q5NCX5 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Neurl4Q5NCX5 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Neurl4Q5NCX5 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Neurl4Q5NCX5 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Neurl4Q5NCX5 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Neurl4Q5NCX5 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Neurl4Q5NCX5 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Neurl4Q5NCX5 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Neurl4Q5NCX5 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Neurl4Q5NCX5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Neurl4Q5NCX5 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Neurl4Q5NCX5 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Neurl4Q5NCX5 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Neurl4Q5NCX5 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Neurl4Q5NCX5 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Neurl4Q5NCX5 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Neurl4Q5NCX5 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Neurl4Q5NCX5 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Neurl4Q5NCX5 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Neurl4Q5NCX5 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Neurl4Q5NCX5 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Neurl4Q5NCX5 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Neurl4Q5NCX5 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Neurl4Q5NCX5 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Neurl4Q5NCX5 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Neurl4Q5NCX5 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Neurl4Q5NCX5 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Neurl4Q5NCX5 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Neurl4Q5NCX5 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Neurl4Q5NCX5 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Neurl4Q5NCX5 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Neurl4Q5NCX5 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Neurl4Q5NCX5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Neurl4Q5NCX5 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Neurl4Q5NCX5 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Neurl4Q5NCX5 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Neurl4Q5NCX5 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Neurl4Q5NCX5 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Neurl4Q5NCX5 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Neurl4Q5NCX5 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Neurl4Q5NCX5 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Neurl4Q5NCX5 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Neurl4Q5NCX5 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Neurl4Q5NCX5 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Neurl4Q5NCX5 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Neurl4Q5NCX5 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Neurl4Q5NCX5 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Neurl4Q5NCX5 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Neurl4Q5NCX5 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Neurl4Q5NCX5 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Neurl4Q5NCX5 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Neurl4Q5NCX5 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Neurl4Q5NCX5 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Neurl4Q5NCX5 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Neurl4Q5NCX5 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Neurl4Q5NCX5 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Neurl4Q5NCX5 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Neurl4Q5NCX5 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Neurl4Q5NCX5 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Neurl4Q5NCX5 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Neurl4Q5NCX5 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Neurl4Q5NCX5 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Neurl4Q5NCX5 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Neurl4Q5NCX5 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Neurl4Q5NCX5 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Neurl4Q5NCX5 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Neurl4Q5NCX5 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms