Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim58Q5NCC9 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim58Q5NCC9 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim58Q5NCC9 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim58Q5NCC9 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim58Q5NCC9 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim58Q5NCC9 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim58Q5NCC9 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim58Q5NCC9 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim58Q5NCC9 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim58Q5NCC9 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim58Q5NCC9 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim58Q5NCC9 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim58Q5NCC9 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim58Q5NCC9 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim58Q5NCC9 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim58Q5NCC9 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim58Q5NCC9 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim58Q5NCC9 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim58Q5NCC9 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim58Q5NCC9 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim58Q5NCC9 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim58Q5NCC9 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim58Q5NCC9 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim58Q5NCC9 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim58Q5NCC9 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim58Q5NCC9 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim58Q5NCC9 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim58Q5NCC9 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim58Q5NCC9 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim58Q5NCC9 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim58Q5NCC9 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim58Q5NCC9 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim58Q5NCC9 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim58Q5NCC9 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim58Q5NCC9 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim58Q5NCC9 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim58Q5NCC9 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim58Q5NCC9 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim58Q5NCC9 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim58Q5NCC9 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim58Q5NCC9 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim58Q5NCC9 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim58Q5NCC9 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim58Q5NCC9 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim58Q5NCC9 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim58Q5NCC9 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim58Q5NCC9 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim58Q5NCC9 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim58Q5NCC9 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim58Q5NCC9 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Trim58Q5NCC9 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Trim58Q5NCC9 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim58Q5NCC9 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim58Q5NCC9 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim58Q5NCC9 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim58Q5NCC9 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim58Q5NCC9 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim58Q5NCC9 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim58Q5NCC9 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim58Q5NCC9 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim58Q5NCC9 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim58Q5NCC9 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim58Q5NCC9 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim58Q5NCC9 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim58Q5NCC9 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim58Q5NCC9 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim58Q5NCC9 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim58Q5NCC9 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim58Q5NCC9 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim58Q5NCC9 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim58Q5NCC9 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim58Q5NCC9 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim58Q5NCC9 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim58Q5NCC9 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim58Q5NCC9 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim58Q5NCC9 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim58Q5NCC9 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim58Q5NCC9 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim58Q5NCC9 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim58Q5NCC9 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim58Q5NCC9 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim58Q5NCC9 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim58Q5NCC9 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim58Q5NCC9 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim58Q5NCC9 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim58Q5NCC9 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim58Q5NCC9 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim58Q5NCC9 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim58Q5NCC9 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim58Q5NCC9 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim58Q5NCC9 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim58Q5NCC9 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim58Q5NCC9 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim58Q5NCC9 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim58Q5NCC9 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim58Q5NCC9 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim58Q5NCC9 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim58Q5NCC9 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim58Q5NCC9 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms