Protein–RNA interactions for Protein: Q52KF3

Spire1, Protein spire homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire1Q52KF3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Spire1Q52KF3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Spire1Q52KF3 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Spire1Q52KF3 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Spire1Q52KF3 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Spire1Q52KF3 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Spire1Q52KF3 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Spire1Q52KF3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Spire1Q52KF3 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Spire1Q52KF3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Spire1Q52KF3 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Spire1Q52KF3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Spire1Q52KF3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Spire1Q52KF3 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Spire1Q52KF3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Spire1Q52KF3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Spire1Q52KF3 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Spire1Q52KF3 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Spire1Q52KF3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Spire1Q52KF3 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Spire1Q52KF3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Spire1Q52KF3 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Spire1Q52KF3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Spire1Q52KF3 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Spire1Q52KF3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Spire1Q52KF3 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Spire1Q52KF3 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Spire1Q52KF3 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Spire1Q52KF3 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Spire1Q52KF3 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Spire1Q52KF3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Spire1Q52KF3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Spire1Q52KF3 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Spire1Q52KF3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Spire1Q52KF3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Spire1Q52KF3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Spire1Q52KF3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Spire1Q52KF3 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Spire1Q52KF3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Spire1Q52KF3 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Spire1Q52KF3 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Spire1Q52KF3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Spire1Q52KF3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Spire1Q52KF3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Spire1Q52KF3 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Spire1Q52KF3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Spire1Q52KF3 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Spire1Q52KF3 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Spire1Q52KF3 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Spire1Q52KF3 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Spire1Q52KF3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Spire1Q52KF3 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Spire1Q52KF3 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Spire1Q52KF3 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Spire1Q52KF3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Spire1Q52KF3 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Spire1Q52KF3 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Spire1Q52KF3 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Spire1Q52KF3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Spire1Q52KF3 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Spire1Q52KF3 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Spire1Q52KF3 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Spire1Q52KF3 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Spire1Q52KF3 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Spire1Q52KF3 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Spire1Q52KF3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Spire1Q52KF3 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Spire1Q52KF3 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Spire1Q52KF3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Spire1Q52KF3 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Spire1Q52KF3 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Spire1Q52KF3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Spire1Q52KF3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Spire1Q52KF3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Spire1Q52KF3 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Spire1Q52KF3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Spire1Q52KF3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Spire1Q52KF3 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Spire1Q52KF3 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Spire1Q52KF3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Spire1Q52KF3 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Spire1Q52KF3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Spire1Q52KF3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Spire1Q52KF3 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Spire1Q52KF3 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Spire1Q52KF3 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Spire1Q52KF3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Spire1Q52KF3 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Spire1Q52KF3 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Spire1Q52KF3 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Spire1Q52KF3 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Spire1Q52KF3 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Spire1Q52KF3 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Spire1Q52KF3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Spire1Q52KF3 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Spire1Q52KF3 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Spire1Q52KF3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Spire1Q52KF3 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Spire1Q52KF3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Spire1Q52KF3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms