Protein–RNA interactions for Protein: Q497S0

Gm5935, EG546282 protein, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5935Q497S0 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm5935Q497S0 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm5935Q497S0 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm5935Q497S0 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm5935Q497S0 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm5935Q497S0 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm5935Q497S0 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm5935Q497S0 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm5935Q497S0 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm5935Q497S0 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm5935Q497S0 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm5935Q497S0 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm5935Q497S0 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm5935Q497S0 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm5935Q497S0 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm5935Q497S0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm5935Q497S0 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm5935Q497S0 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm5935Q497S0 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm5935Q497S0 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm5935Q497S0 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm5935Q497S0 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm5935Q497S0 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm5935Q497S0 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm5935Q497S0 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm5935Q497S0 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm5935Q497S0 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm5935Q497S0 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm5935Q497S0 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm5935Q497S0 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm5935Q497S0 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm5935Q497S0 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm5935Q497S0 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm5935Q497S0 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm5935Q497S0 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm5935Q497S0 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm5935Q497S0 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm5935Q497S0 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm5935Q497S0 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm5935Q497S0 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm5935Q497S0 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm5935Q497S0 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm5935Q497S0 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm5935Q497S0 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm5935Q497S0 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm5935Q497S0 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm5935Q497S0 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm5935Q497S0 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm5935Q497S0 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm5935Q497S0 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm5935Q497S0 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm5935Q497S0 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm5935Q497S0 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm5935Q497S0 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm5935Q497S0 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm5935Q497S0 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm5935Q497S0 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm5935Q497S0 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm5935Q497S0 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm5935Q497S0 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm5935Q497S0 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm5935Q497S0 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm5935Q497S0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm5935Q497S0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm5935Q497S0 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm5935Q497S0 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm5935Q497S0 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm5935Q497S0 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm5935Q497S0 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm5935Q497S0 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm5935Q497S0 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm5935Q497S0 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm5935Q497S0 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm5935Q497S0 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm5935Q497S0 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm5935Q497S0 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm5935Q497S0 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm5935Q497S0 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm5935Q497S0 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm5935Q497S0 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm5935Q497S0 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm5935Q497S0 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm5935Q497S0 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm5935Q497S0 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm5935Q497S0 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm5935Q497S0 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm5935Q497S0 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm5935Q497S0 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm5935Q497S0 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm5935Q497S0 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm5935Q497S0 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm5935Q497S0 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm5935Q497S0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm5935Q497S0 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm5935Q497S0 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm5935Q497S0 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm5935Q497S0 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm5935Q497S0 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm5935Q497S0 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm5935Q497S0 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 210 ms