Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3V9

Carmil2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil2Q3V3V9 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Carmil2Q3V3V9 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Carmil2Q3V3V9 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Carmil2Q3V3V9 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Carmil2Q3V3V9 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Carmil2Q3V3V9 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Carmil2Q3V3V9 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Carmil2Q3V3V9 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Carmil2Q3V3V9 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Carmil2Q3V3V9 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Carmil2Q3V3V9 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Carmil2Q3V3V9 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Carmil2Q3V3V9 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Carmil2Q3V3V9 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Carmil2Q3V3V9 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Carmil2Q3V3V9 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Carmil2Q3V3V9 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Carmil2Q3V3V9 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Carmil2Q3V3V9 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Carmil2Q3V3V9 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Carmil2Q3V3V9 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Carmil2Q3V3V9 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Carmil2Q3V3V9 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Carmil2Q3V3V9 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Carmil2Q3V3V9 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Carmil2Q3V3V9 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Carmil2Q3V3V9 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Carmil2Q3V3V9 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Carmil2Q3V3V9 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Carmil2Q3V3V9 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Carmil2Q3V3V9 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Carmil2Q3V3V9 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Carmil2Q3V3V9 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Carmil2Q3V3V9 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Carmil2Q3V3V9 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Carmil2Q3V3V9 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Carmil2Q3V3V9 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Carmil2Q3V3V9 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Carmil2Q3V3V9 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Carmil2Q3V3V9 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Carmil2Q3V3V9 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Carmil2Q3V3V9 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Carmil2Q3V3V9 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Carmil2Q3V3V9 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Carmil2Q3V3V9 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Carmil2Q3V3V9 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Carmil2Q3V3V9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Carmil2Q3V3V9 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Carmil2Q3V3V9 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Carmil2Q3V3V9 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Carmil2Q3V3V9 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Carmil2Q3V3V9 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Carmil2Q3V3V9 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Carmil2Q3V3V9 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Carmil2Q3V3V9 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Carmil2Q3V3V9 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Carmil2Q3V3V9 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Carmil2Q3V3V9 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Carmil2Q3V3V9 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Carmil2Q3V3V9 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Carmil2Q3V3V9 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Carmil2Q3V3V9 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Carmil2Q3V3V9 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Carmil2Q3V3V9 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Carmil2Q3V3V9 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Carmil2Q3V3V9 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Carmil2Q3V3V9 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Carmil2Q3V3V9 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Carmil2Q3V3V9 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Carmil2Q3V3V9 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Carmil2Q3V3V9 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Carmil2Q3V3V9 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Carmil2Q3V3V9 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Carmil2Q3V3V9 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Carmil2Q3V3V9 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Carmil2Q3V3V9 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Carmil2Q3V3V9 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Carmil2Q3V3V9 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Carmil2Q3V3V9 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Carmil2Q3V3V9 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Carmil2Q3V3V9 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Carmil2Q3V3V9 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Carmil2Q3V3V9 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Carmil2Q3V3V9 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Carmil2Q3V3V9 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Carmil2Q3V3V9 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Carmil2Q3V3V9 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Carmil2Q3V3V9 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Carmil2Q3V3V9 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Carmil2Q3V3V9 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Carmil2Q3V3V9 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Carmil2Q3V3V9 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Carmil2Q3V3V9 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Carmil2Q3V3V9 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Carmil2Q3V3V9 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Carmil2Q3V3V9 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Carmil2Q3V3V9 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Carmil2Q3V3V9 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Carmil2Q3V3V9 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Carmil2Q3V3V9 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms