Protein–RNA interactions for Protein: Q3V125

Ccdc110, Coiled-coil domain-containing protein 110, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc110Q3V125 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc110Q3V125 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc110Q3V125 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc110Q3V125 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc110Q3V125 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc110Q3V125 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc110Q3V125 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc110Q3V125 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc110Q3V125 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc110Q3V125 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc110Q3V125 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc110Q3V125 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc110Q3V125 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc110Q3V125 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc110Q3V125 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc110Q3V125 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc110Q3V125 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc110Q3V125 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc110Q3V125 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc110Q3V125 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc110Q3V125 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc110Q3V125 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc110Q3V125 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc110Q3V125 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc110Q3V125 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc110Q3V125 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc110Q3V125 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc110Q3V125 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc110Q3V125 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc110Q3V125 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc110Q3V125 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc110Q3V125 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc110Q3V125 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc110Q3V125 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc110Q3V125 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc110Q3V125 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc110Q3V125 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc110Q3V125 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc110Q3V125 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc110Q3V125 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc110Q3V125 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc110Q3V125 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc110Q3V125 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc110Q3V125 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc110Q3V125 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc110Q3V125 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc110Q3V125 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc110Q3V125 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc110Q3V125 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc110Q3V125 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc110Q3V125 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc110Q3V125 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc110Q3V125 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc110Q3V125 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc110Q3V125 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc110Q3V125 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc110Q3V125 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc110Q3V125 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc110Q3V125 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc110Q3V125 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc110Q3V125 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc110Q3V125 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc110Q3V125 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc110Q3V125 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc110Q3V125 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc110Q3V125 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc110Q3V125 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc110Q3V125 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc110Q3V125 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc110Q3V125 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc110Q3V125 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc110Q3V125 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc110Q3V125 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc110Q3V125 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc110Q3V125 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc110Q3V125 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc110Q3V125 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc110Q3V125 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc110Q3V125 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ccdc110Q3V125 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc110Q3V125 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc110Q3V125 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc110Q3V125 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc110Q3V125 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc110Q3V125 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc110Q3V125 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc110Q3V125 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc110Q3V125 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc110Q3V125 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc110Q3V125 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc110Q3V125 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc110Q3V125 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc110Q3V125 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc110Q3V125 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc110Q3V125 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc110Q3V125 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc110Q3V125 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc110Q3V125 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc110Q3V125 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc110Q3V125 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms