Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0X1

Smim9, Small integral membrane protein 9, mousemouse

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Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim9Q3V0X1 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim9Q3V0X1 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim9Q3V0X1 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim9Q3V0X1 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Smim9Q3V0X1 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Smim9Q3V0X1 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Smim9Q3V0X1 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Smim9Q3V0X1 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Smim9Q3V0X1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Smim9Q3V0X1 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Smim9Q3V0X1 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Smim9Q3V0X1 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Smim9Q3V0X1 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Smim9Q3V0X1 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Smim9Q3V0X1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smim9Q3V0X1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smim9Q3V0X1 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smim9Q3V0X1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smim9Q3V0X1 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smim9Q3V0X1 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Smim9Q3V0X1 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smim9Q3V0X1 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smim9Q3V0X1 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smim9Q3V0X1 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smim9Q3V0X1 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smim9Q3V0X1 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smim9Q3V0X1 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smim9Q3V0X1 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim9Q3V0X1 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim9Q3V0X1 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim9Q3V0X1 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim9Q3V0X1 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim9Q3V0X1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim9Q3V0X1 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim9Q3V0X1 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim9Q3V0X1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim9Q3V0X1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim9Q3V0X1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim9Q3V0X1 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim9Q3V0X1 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim9Q3V0X1 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim9Q3V0X1 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim9Q3V0X1 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim9Q3V0X1 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim9Q3V0X1 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim9Q3V0X1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim9Q3V0X1 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim9Q3V0X1 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim9Q3V0X1 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim9Q3V0X1 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim9Q3V0X1 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim9Q3V0X1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim9Q3V0X1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim9Q3V0X1 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim9Q3V0X1 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim9Q3V0X1 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim9Q3V0X1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim9Q3V0X1 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim9Q3V0X1 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim9Q3V0X1 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim9Q3V0X1 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim9Q3V0X1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim9Q3V0X1 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim9Q3V0X1 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim9Q3V0X1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim9Q3V0X1 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim9Q3V0X1 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim9Q3V0X1 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim9Q3V0X1 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim9Q3V0X1 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim9Q3V0X1 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim9Q3V0X1 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim9Q3V0X1 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim9Q3V0X1 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim9Q3V0X1 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim9Q3V0X1 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim9Q3V0X1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim9Q3V0X1 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim9Q3V0X1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim9Q3V0X1 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim9Q3V0X1 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim9Q3V0X1 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim9Q3V0X1 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim9Q3V0X1 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim9Q3V0X1 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim9Q3V0X1 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim9Q3V0X1 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim9Q3V0X1 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim9Q3V0X1 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim9Q3V0X1 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim9Q3V0X1 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim9Q3V0X1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim9Q3V0X1 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smim9Q3V0X1 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smim9Q3V0X1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smim9Q3V0X1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smim9Q3V0X1 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smim9Q3V0X1 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smim9Q3V0X1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smim9Q3V0X1 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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