Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0M2

Lrrc36, Leucine-rich repeat-containing protein 36, mousemouse

Predictions only

Length 755 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc36Q3V0M2 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrc36Q3V0M2 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrc36Q3V0M2 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrc36Q3V0M2 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrc36Q3V0M2 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrc36Q3V0M2 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrc36Q3V0M2 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrc36Q3V0M2 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrc36Q3V0M2 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrc36Q3V0M2 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrc36Q3V0M2 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrc36Q3V0M2 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrc36Q3V0M2 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrc36Q3V0M2 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrc36Q3V0M2 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrc36Q3V0M2 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrc36Q3V0M2 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrc36Q3V0M2 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrc36Q3V0M2 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrc36Q3V0M2 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrc36Q3V0M2 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrc36Q3V0M2 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrrc36Q3V0M2 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrrc36Q3V0M2 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrrc36Q3V0M2 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrrc36Q3V0M2 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrrc36Q3V0M2 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrrc36Q3V0M2 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrrc36Q3V0M2 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrrc36Q3V0M2 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrrc36Q3V0M2 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrrc36Q3V0M2 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrrc36Q3V0M2 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrc36Q3V0M2 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrc36Q3V0M2 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrc36Q3V0M2 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrc36Q3V0M2 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrc36Q3V0M2 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrc36Q3V0M2 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrc36Q3V0M2 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrc36Q3V0M2 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrc36Q3V0M2 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrc36Q3V0M2 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrc36Q3V0M2 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrc36Q3V0M2 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrc36Q3V0M2 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrc36Q3V0M2 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrc36Q3V0M2 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrrc36Q3V0M2 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrrc36Q3V0M2 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrrc36Q3V0M2 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrrc36Q3V0M2 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrrc36Q3V0M2 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrc36Q3V0M2 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrc36Q3V0M2 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrc36Q3V0M2 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrc36Q3V0M2 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrc36Q3V0M2 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrc36Q3V0M2 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrc36Q3V0M2 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrrc36Q3V0M2 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrrc36Q3V0M2 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrrc36Q3V0M2 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrrc36Q3V0M2 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrrc36Q3V0M2 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrrc36Q3V0M2 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrc36Q3V0M2 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrc36Q3V0M2 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrc36Q3V0M2 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrc36Q3V0M2 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrc36Q3V0M2 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrc36Q3V0M2 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrc36Q3V0M2 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrc36Q3V0M2 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrc36Q3V0M2 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrc36Q3V0M2 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrc36Q3V0M2 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrc36Q3V0M2 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrc36Q3V0M2 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrc36Q3V0M2 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrc36Q3V0M2 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrrc36Q3V0M2 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrrc36Q3V0M2 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrrc36Q3V0M2 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrrc36Q3V0M2 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrrc36Q3V0M2 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrrc36Q3V0M2 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrrc36Q3V0M2 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrrc36Q3V0M2 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrc36Q3V0M2 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrc36Q3V0M2 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrc36Q3V0M2 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrc36Q3V0M2 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrc36Q3V0M2 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrc36Q3V0M2 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrc36Q3V0M2 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrc36Q3V0M2 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrc36Q3V0M2 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrc36Q3V0M2 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrc36Q3V0M2 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms