Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lrrc43Q3V0L5 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lrrc43Q3V0L5 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lrrc43Q3V0L5 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lrrc43Q3V0L5 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lrrc43Q3V0L5 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lrrc43Q3V0L5 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lrrc43Q3V0L5 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lrrc43Q3V0L5 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lrrc43Q3V0L5 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lrrc43Q3V0L5 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lrrc43Q3V0L5 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lrrc43Q3V0L5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lrrc43Q3V0L5 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lrrc43Q3V0L5 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lrrc43Q3V0L5 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lrrc43Q3V0L5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lrrc43Q3V0L5 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lrrc43Q3V0L5 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lrrc43Q3V0L5 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Lrrc43Q3V0L5 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lrrc43Q3V0L5 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lrrc43Q3V0L5 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lrrc43Q3V0L5 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lrrc43Q3V0L5 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lrrc43Q3V0L5 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lrrc43Q3V0L5 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lrrc43Q3V0L5 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Lrrc43Q3V0L5 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lrrc43Q3V0L5 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Lrrc43Q3V0L5 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lrrc43Q3V0L5 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Lrrc43Q3V0L5 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lrrc43Q3V0L5 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lrrc43Q3V0L5 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lrrc43Q3V0L5 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lrrc43Q3V0L5 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lrrc43Q3V0L5 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lrrc43Q3V0L5 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lrrc43Q3V0L5 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Lrrc43Q3V0L5 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lrrc43Q3V0L5 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lrrc43Q3V0L5 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lrrc43Q3V0L5 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lrrc43Q3V0L5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lrrc43Q3V0L5 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lrrc43Q3V0L5 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lrrc43Q3V0L5 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lrrc43Q3V0L5 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lrrc43Q3V0L5 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lrrc43Q3V0L5 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lrrc43Q3V0L5 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lrrc43Q3V0L5 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lrrc43Q3V0L5 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lrrc43Q3V0L5 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lrrc43Q3V0L5 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lrrc43Q3V0L5 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lrrc43Q3V0L5 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lrrc43Q3V0L5 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lrrc43Q3V0L5 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Lrrc43Q3V0L5 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lrrc43Q3V0L5 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lrrc43Q3V0L5 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lrrc43Q3V0L5 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lrrc43Q3V0L5 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lrrc43Q3V0L5 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Lrrc43Q3V0L5 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Lrrc43Q3V0L5 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Lrrc43Q3V0L5 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lrrc43Q3V0L5 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lrrc43Q3V0L5 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lrrc43Q3V0L5 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lrrc43Q3V0L5 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lrrc43Q3V0L5 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Lrrc43Q3V0L5 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lrrc43Q3V0L5 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lrrc43Q3V0L5 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lrrc43Q3V0L5 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lrrc43Q3V0L5 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lrrc43Q3V0L5 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lrrc43Q3V0L5 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lrrc43Q3V0L5 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lrrc43Q3V0L5 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lrrc43Q3V0L5 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lrrc43Q3V0L5 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Lrrc43Q3V0L5 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lrrc43Q3V0L5 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lrrc43Q3V0L5 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Lrrc43Q3V0L5 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lrrc43Q3V0L5 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lrrc43Q3V0L5 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lrrc43Q3V0L5 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lrrc43Q3V0L5 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lrrc43Q3V0L5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lrrc43Q3V0L5 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lrrc43Q3V0L5 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lrrc43Q3V0L5 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lrrc43Q3V0L5 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lrrc43Q3V0L5 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lrrc43Q3V0L5 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
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