Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYV9

Ncbp1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncbp1Q3UYV9 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ncbp1Q3UYV9 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ncbp1Q3UYV9 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ncbp1Q3UYV9 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ncbp1Q3UYV9 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ncbp1Q3UYV9 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ncbp1Q3UYV9 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ncbp1Q3UYV9 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ncbp1Q3UYV9 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ncbp1Q3UYV9 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ncbp1Q3UYV9 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ncbp1Q3UYV9 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ncbp1Q3UYV9 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ncbp1Q3UYV9 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ncbp1Q3UYV9 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ncbp1Q3UYV9 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ncbp1Q3UYV9 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ncbp1Q3UYV9 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ncbp1Q3UYV9 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ncbp1Q3UYV9 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ncbp1Q3UYV9 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ncbp1Q3UYV9 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ncbp1Q3UYV9 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ncbp1Q3UYV9 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ncbp1Q3UYV9 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ncbp1Q3UYV9 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ncbp1Q3UYV9 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ncbp1Q3UYV9 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ncbp1Q3UYV9 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ncbp1Q3UYV9 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ncbp1Q3UYV9 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ncbp1Q3UYV9 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ncbp1Q3UYV9 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ncbp1Q3UYV9 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ncbp1Q3UYV9 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ncbp1Q3UYV9 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ncbp1Q3UYV9 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ncbp1Q3UYV9 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ncbp1Q3UYV9 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ncbp1Q3UYV9 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ncbp1Q3UYV9 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ncbp1Q3UYV9 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ncbp1Q3UYV9 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ncbp1Q3UYV9 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ncbp1Q3UYV9 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ncbp1Q3UYV9 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ncbp1Q3UYV9 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ncbp1Q3UYV9 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ncbp1Q3UYV9 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ncbp1Q3UYV9 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ncbp1Q3UYV9 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ncbp1Q3UYV9 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ncbp1Q3UYV9 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ncbp1Q3UYV9 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ncbp1Q3UYV9 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ncbp1Q3UYV9 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ncbp1Q3UYV9 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ncbp1Q3UYV9 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ncbp1Q3UYV9 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ncbp1Q3UYV9 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ncbp1Q3UYV9 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ncbp1Q3UYV9 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ncbp1Q3UYV9 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ncbp1Q3UYV9 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ncbp1Q3UYV9 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ncbp1Q3UYV9 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ncbp1Q3UYV9 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ncbp1Q3UYV9 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ncbp1Q3UYV9 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ncbp1Q3UYV9 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ncbp1Q3UYV9 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ncbp1Q3UYV9 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ncbp1Q3UYV9 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ncbp1Q3UYV9 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ncbp1Q3UYV9 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Ncbp1Q3UYV9 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Ncbp1Q3UYV9 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Ncbp1Q3UYV9 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ncbp1Q3UYV9 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ncbp1Q3UYV9 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ncbp1Q3UYV9 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ncbp1Q3UYV9 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ncbp1Q3UYV9 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ncbp1Q3UYV9 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ncbp1Q3UYV9 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ncbp1Q3UYV9 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ncbp1Q3UYV9 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ncbp1Q3UYV9 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ncbp1Q3UYV9 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ncbp1Q3UYV9 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ncbp1Q3UYV9 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ncbp1Q3UYV9 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ncbp1Q3UYV9 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ncbp1Q3UYV9 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ncbp1Q3UYV9 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ncbp1Q3UYV9 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ncbp1Q3UYV9 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ncbp1Q3UYV9 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ncbp1Q3UYV9 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ncbp1Q3UYV9 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms