Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYV8

Dnaaf3, Dynein assembly factor 3, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaaf3Q3UYV8 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dnaaf3Q3UYV8 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dnaaf3Q3UYV8 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dnaaf3Q3UYV8 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dnaaf3Q3UYV8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dnaaf3Q3UYV8 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dnaaf3Q3UYV8 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dnaaf3Q3UYV8 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dnaaf3Q3UYV8 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dnaaf3Q3UYV8 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dnaaf3Q3UYV8 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dnaaf3Q3UYV8 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dnaaf3Q3UYV8 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dnaaf3Q3UYV8 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dnaaf3Q3UYV8 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dnaaf3Q3UYV8 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dnaaf3Q3UYV8 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dnaaf3Q3UYV8 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dnaaf3Q3UYV8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dnaaf3Q3UYV8 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dnaaf3Q3UYV8 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dnaaf3Q3UYV8 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dnaaf3Q3UYV8 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dnaaf3Q3UYV8 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dnaaf3Q3UYV8 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dnaaf3Q3UYV8 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dnaaf3Q3UYV8 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dnaaf3Q3UYV8 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dnaaf3Q3UYV8 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dnaaf3Q3UYV8 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dnaaf3Q3UYV8 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dnaaf3Q3UYV8 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Dnaaf3Q3UYV8 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dnaaf3Q3UYV8 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dnaaf3Q3UYV8 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dnaaf3Q3UYV8 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dnaaf3Q3UYV8 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dnaaf3Q3UYV8 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dnaaf3Q3UYV8 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dnaaf3Q3UYV8 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dnaaf3Q3UYV8 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dnaaf3Q3UYV8 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dnaaf3Q3UYV8 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dnaaf3Q3UYV8 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Dnaaf3Q3UYV8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dnaaf3Q3UYV8 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dnaaf3Q3UYV8 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dnaaf3Q3UYV8 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dnaaf3Q3UYV8 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dnaaf3Q3UYV8 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dnaaf3Q3UYV8 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dnaaf3Q3UYV8 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dnaaf3Q3UYV8 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dnaaf3Q3UYV8 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dnaaf3Q3UYV8 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dnaaf3Q3UYV8 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dnaaf3Q3UYV8 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dnaaf3Q3UYV8 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dnaaf3Q3UYV8 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dnaaf3Q3UYV8 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dnaaf3Q3UYV8 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dnaaf3Q3UYV8 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dnaaf3Q3UYV8 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dnaaf3Q3UYV8 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dnaaf3Q3UYV8 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dnaaf3Q3UYV8 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dnaaf3Q3UYV8 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dnaaf3Q3UYV8 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Dnaaf3Q3UYV8 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dnaaf3Q3UYV8 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dnaaf3Q3UYV8 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dnaaf3Q3UYV8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dnaaf3Q3UYV8 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dnaaf3Q3UYV8 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Dnaaf3Q3UYV8 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dnaaf3Q3UYV8 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Dnaaf3Q3UYV8 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Dnaaf3Q3UYV8 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Dnaaf3Q3UYV8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dnaaf3Q3UYV8 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dnaaf3Q3UYV8 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dnaaf3Q3UYV8 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dnaaf3Q3UYV8 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dnaaf3Q3UYV8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dnaaf3Q3UYV8 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dnaaf3Q3UYV8 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dnaaf3Q3UYV8 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dnaaf3Q3UYV8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dnaaf3Q3UYV8 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dnaaf3Q3UYV8 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dnaaf3Q3UYV8 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dnaaf3Q3UYV8 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dnaaf3Q3UYV8 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dnaaf3Q3UYV8 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dnaaf3Q3UYV8 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dnaaf3Q3UYV8 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dnaaf3Q3UYV8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dnaaf3Q3UYV8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dnaaf3Q3UYV8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dnaaf3Q3UYV8 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms