Protein–RNA interactions for Protein: Q3UY51

Lrrc55, Leucine-rich repeat-containing protein 55, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc55Q3UY51 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrrc55Q3UY51 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrrc55Q3UY51 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrrc55Q3UY51 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrrc55Q3UY51 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrrc55Q3UY51 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrrc55Q3UY51 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrrc55Q3UY51 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrrc55Q3UY51 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrrc55Q3UY51 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrrc55Q3UY51 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrrc55Q3UY51 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lrrc55Q3UY51 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lrrc55Q3UY51 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrrc55Q3UY51 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrrc55Q3UY51 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrrc55Q3UY51 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrrc55Q3UY51 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrrc55Q3UY51 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrrc55Q3UY51 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrrc55Q3UY51 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrrc55Q3UY51 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrrc55Q3UY51 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrrc55Q3UY51 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrrc55Q3UY51 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrrc55Q3UY51 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrrc55Q3UY51 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrrc55Q3UY51 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrrc55Q3UY51 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrrc55Q3UY51 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrrc55Q3UY51 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrrc55Q3UY51 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrrc55Q3UY51 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrrc55Q3UY51 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrrc55Q3UY51 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrrc55Q3UY51 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrrc55Q3UY51 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrrc55Q3UY51 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrrc55Q3UY51 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrrc55Q3UY51 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrrc55Q3UY51 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrrc55Q3UY51 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrrc55Q3UY51 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrrc55Q3UY51 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrrc55Q3UY51 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrrc55Q3UY51 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrrc55Q3UY51 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrrc55Q3UY51 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrrc55Q3UY51 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrrc55Q3UY51 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrrc55Q3UY51 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrrc55Q3UY51 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrrc55Q3UY51 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrrc55Q3UY51 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrrc55Q3UY51 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrrc55Q3UY51 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrrc55Q3UY51 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrrc55Q3UY51 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrrc55Q3UY51 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrrc55Q3UY51 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrrc55Q3UY51 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrrc55Q3UY51 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrrc55Q3UY51 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrrc55Q3UY51 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrrc55Q3UY51 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrrc55Q3UY51 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrrc55Q3UY51 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrrc55Q3UY51 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrrc55Q3UY51 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrrc55Q3UY51 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrrc55Q3UY51 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrrc55Q3UY51 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrrc55Q3UY51 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrrc55Q3UY51 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrrc55Q3UY51 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrrc55Q3UY51 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrrc55Q3UY51 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrrc55Q3UY51 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrrc55Q3UY51 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrrc55Q3UY51 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Lrrc55Q3UY51 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Lrrc55Q3UY51 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Lrrc55Q3UY51 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Lrrc55Q3UY51 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrrc55Q3UY51 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrrc55Q3UY51 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrrc55Q3UY51 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Lrrc55Q3UY51 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrrc55Q3UY51 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrrc55Q3UY51 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Lrrc55Q3UY51 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lrrc55Q3UY51 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lrrc55Q3UY51 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Lrrc55Q3UY51 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Lrrc55Q3UY51 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Lrrc55Q3UY51 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Lrrc55Q3UY51 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lrrc55Q3UY51 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lrrc55Q3UY51 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lrrc55Q3UY51 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms