Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXZ9

Kdm5a, Lysine-specific demethylase 5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,690 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5aQ3UXZ9 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Kdm5aQ3UXZ9 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Kdm5aQ3UXZ9 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Kdm5aQ3UXZ9 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Kdm5aQ3UXZ9 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Kdm5aQ3UXZ9 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Kdm5aQ3UXZ9 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Kdm5aQ3UXZ9 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Kdm5aQ3UXZ9 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Kdm5aQ3UXZ9 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Kdm5aQ3UXZ9 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Kdm5aQ3UXZ9 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Kdm5aQ3UXZ9 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Kdm5aQ3UXZ9 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Kdm5aQ3UXZ9 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Kdm5aQ3UXZ9 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Kdm5aQ3UXZ9 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Kdm5aQ3UXZ9 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Kdm5aQ3UXZ9 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Kdm5aQ3UXZ9 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Kdm5aQ3UXZ9 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Kdm5aQ3UXZ9 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Kdm5aQ3UXZ9 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Kdm5aQ3UXZ9 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Kdm5aQ3UXZ9 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Kdm5aQ3UXZ9 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Kdm5aQ3UXZ9 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Kdm5aQ3UXZ9 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Kdm5aQ3UXZ9 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Kdm5aQ3UXZ9 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Kdm5aQ3UXZ9 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Kdm5aQ3UXZ9 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Kdm5aQ3UXZ9 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Kdm5aQ3UXZ9 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Kdm5aQ3UXZ9 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Kdm5aQ3UXZ9 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Kdm5aQ3UXZ9 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Kdm5aQ3UXZ9 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Kdm5aQ3UXZ9 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Kdm5aQ3UXZ9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Kdm5aQ3UXZ9 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Kdm5aQ3UXZ9 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Kdm5aQ3UXZ9 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Kdm5aQ3UXZ9 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Kdm5aQ3UXZ9 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
Kdm5aQ3UXZ9 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Kdm5aQ3UXZ9 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
Kdm5aQ3UXZ9 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Kdm5aQ3UXZ9 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Kdm5aQ3UXZ9 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Kdm5aQ3UXZ9 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Kdm5aQ3UXZ9 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Kdm5aQ3UXZ9 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Kdm5aQ3UXZ9 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Kdm5aQ3UXZ9 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Kdm5aQ3UXZ9 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Kdm5aQ3UXZ9 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Kdm5aQ3UXZ9 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Kdm5aQ3UXZ9 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Kdm5aQ3UXZ9 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Kdm5aQ3UXZ9 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Kdm5aQ3UXZ9 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Kdm5aQ3UXZ9 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Kdm5aQ3UXZ9 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Kdm5aQ3UXZ9 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Kdm5aQ3UXZ9 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Kdm5aQ3UXZ9 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Kdm5aQ3UXZ9 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Kdm5aQ3UXZ9 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Kdm5aQ3UXZ9 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Kdm5aQ3UXZ9 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Kdm5aQ3UXZ9 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Kdm5aQ3UXZ9 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Kdm5aQ3UXZ9 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Kdm5aQ3UXZ9 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Kdm5aQ3UXZ9 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Kdm5aQ3UXZ9 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Kdm5aQ3UXZ9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Kdm5aQ3UXZ9 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Kdm5aQ3UXZ9 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Kdm5aQ3UXZ9 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Kdm5aQ3UXZ9 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Kdm5aQ3UXZ9 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Kdm5aQ3UXZ9 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Kdm5aQ3UXZ9 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Kdm5aQ3UXZ9 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Kdm5aQ3UXZ9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Kdm5aQ3UXZ9 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Kdm5aQ3UXZ9 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Kdm5aQ3UXZ9 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Kdm5aQ3UXZ9 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Kdm5aQ3UXZ9 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Kdm5aQ3UXZ9 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Kdm5aQ3UXZ9 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Kdm5aQ3UXZ9 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Kdm5aQ3UXZ9 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Kdm5aQ3UXZ9 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Kdm5aQ3UXZ9 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Kdm5aQ3UXZ9 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Kdm5aQ3UXZ9 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
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