Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW21

Clpsl2, Colipase-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clpsl2Q3UW21 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Clpsl2Q3UW21 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Clpsl2Q3UW21 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Clpsl2Q3UW21 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Clpsl2Q3UW21 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Clpsl2Q3UW21 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Clpsl2Q3UW21 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Clpsl2Q3UW21 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Clpsl2Q3UW21 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clpsl2Q3UW21 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clpsl2Q3UW21 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clpsl2Q3UW21 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clpsl2Q3UW21 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clpsl2Q3UW21 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clpsl2Q3UW21 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clpsl2Q3UW21 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clpsl2Q3UW21 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clpsl2Q3UW21 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clpsl2Q3UW21 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clpsl2Q3UW21 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Clpsl2Q3UW21 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Clpsl2Q3UW21 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Clpsl2Q3UW21 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Clpsl2Q3UW21 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Clpsl2Q3UW21 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Clpsl2Q3UW21 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Clpsl2Q3UW21 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Clpsl2Q3UW21 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Clpsl2Q3UW21 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Clpsl2Q3UW21 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Clpsl2Q3UW21 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Clpsl2Q3UW21 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Clpsl2Q3UW21 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clpsl2Q3UW21 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clpsl2Q3UW21 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clpsl2Q3UW21 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clpsl2Q3UW21 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Clpsl2Q3UW21 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clpsl2Q3UW21 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clpsl2Q3UW21 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clpsl2Q3UW21 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clpsl2Q3UW21 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clpsl2Q3UW21 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clpsl2Q3UW21 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clpsl2Q3UW21 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clpsl2Q3UW21 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clpsl2Q3UW21 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clpsl2Q3UW21 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Clpsl2Q3UW21 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clpsl2Q3UW21 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Clpsl2Q3UW21 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clpsl2Q3UW21 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clpsl2Q3UW21 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clpsl2Q3UW21 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clpsl2Q3UW21 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clpsl2Q3UW21 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clpsl2Q3UW21 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clpsl2Q3UW21 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clpsl2Q3UW21 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clpsl2Q3UW21 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clpsl2Q3UW21 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clpsl2Q3UW21 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clpsl2Q3UW21 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clpsl2Q3UW21 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clpsl2Q3UW21 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clpsl2Q3UW21 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clpsl2Q3UW21 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Clpsl2Q3UW21 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Clpsl2Q3UW21 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Clpsl2Q3UW21 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Clpsl2Q3UW21 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Clpsl2Q3UW21 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Clpsl2Q3UW21 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Clpsl2Q3UW21 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Clpsl2Q3UW21 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clpsl2Q3UW21 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clpsl2Q3UW21 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clpsl2Q3UW21 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clpsl2Q3UW21 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clpsl2Q3UW21 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clpsl2Q3UW21 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clpsl2Q3UW21 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clpsl2Q3UW21 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clpsl2Q3UW21 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clpsl2Q3UW21 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clpsl2Q3UW21 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clpsl2Q3UW21 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clpsl2Q3UW21 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clpsl2Q3UW21 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clpsl2Q3UW21 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clpsl2Q3UW21 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clpsl2Q3UW21 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clpsl2Q3UW21 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Clpsl2Q3UW21 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clpsl2Q3UW21 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clpsl2Q3UW21 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clpsl2Q3UW21 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clpsl2Q3UW21 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clpsl2Q3UW21 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clpsl2Q3UW21 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms