Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUY6

Prom2, Prominin-2, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prom2Q3UUY6 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prom2Q3UUY6 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prom2Q3UUY6 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prom2Q3UUY6 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prom2Q3UUY6 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prom2Q3UUY6 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prom2Q3UUY6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prom2Q3UUY6 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prom2Q3UUY6 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prom2Q3UUY6 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Prom2Q3UUY6 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prom2Q3UUY6 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prom2Q3UUY6 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prom2Q3UUY6 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prom2Q3UUY6 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prom2Q3UUY6 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prom2Q3UUY6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prom2Q3UUY6 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prom2Q3UUY6 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prom2Q3UUY6 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prom2Q3UUY6 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prom2Q3UUY6 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prom2Q3UUY6 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prom2Q3UUY6 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prom2Q3UUY6 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prom2Q3UUY6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prom2Q3UUY6 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prom2Q3UUY6 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prom2Q3UUY6 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prom2Q3UUY6 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prom2Q3UUY6 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prom2Q3UUY6 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prom2Q3UUY6 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prom2Q3UUY6 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prom2Q3UUY6 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prom2Q3UUY6 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prom2Q3UUY6 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prom2Q3UUY6 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prom2Q3UUY6 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prom2Q3UUY6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prom2Q3UUY6 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Prom2Q3UUY6 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prom2Q3UUY6 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prom2Q3UUY6 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Prom2Q3UUY6 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prom2Q3UUY6 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prom2Q3UUY6 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prom2Q3UUY6 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prom2Q3UUY6 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prom2Q3UUY6 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prom2Q3UUY6 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prom2Q3UUY6 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prom2Q3UUY6 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prom2Q3UUY6 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prom2Q3UUY6 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prom2Q3UUY6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Prom2Q3UUY6 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Prom2Q3UUY6 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Prom2Q3UUY6 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prom2Q3UUY6 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prom2Q3UUY6 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prom2Q3UUY6 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prom2Q3UUY6 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prom2Q3UUY6 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Prom2Q3UUY6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prom2Q3UUY6 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prom2Q3UUY6 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prom2Q3UUY6 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prom2Q3UUY6 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prom2Q3UUY6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prom2Q3UUY6 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prom2Q3UUY6 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prom2Q3UUY6 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prom2Q3UUY6 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prom2Q3UUY6 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prom2Q3UUY6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prom2Q3UUY6 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prom2Q3UUY6 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prom2Q3UUY6 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prom2Q3UUY6 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prom2Q3UUY6 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prom2Q3UUY6 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Prom2Q3UUY6 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prom2Q3UUY6 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prom2Q3UUY6 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prom2Q3UUY6 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prom2Q3UUY6 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prom2Q3UUY6 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prom2Q3UUY6 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prom2Q3UUY6 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Prom2Q3UUY6 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prom2Q3UUY6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prom2Q3UUY6 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prom2Q3UUY6 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prom2Q3UUY6 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prom2Q3UUY6 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prom2Q3UUY6 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prom2Q3UUY6 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Prom2Q3UUY6 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prom2Q3UUY6 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms