Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTQ8

Cdkl5, Cyclin-dependent kinase-like 5, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl5Q3UTQ8 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdkl5Q3UTQ8 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdkl5Q3UTQ8 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdkl5Q3UTQ8 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdkl5Q3UTQ8 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdkl5Q3UTQ8 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdkl5Q3UTQ8 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdkl5Q3UTQ8 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdkl5Q3UTQ8 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdkl5Q3UTQ8 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdkl5Q3UTQ8 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdkl5Q3UTQ8 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdkl5Q3UTQ8 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdkl5Q3UTQ8 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdkl5Q3UTQ8 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdkl5Q3UTQ8 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdkl5Q3UTQ8 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdkl5Q3UTQ8 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdkl5Q3UTQ8 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdkl5Q3UTQ8 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdkl5Q3UTQ8 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdkl5Q3UTQ8 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdkl5Q3UTQ8 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdkl5Q3UTQ8 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdkl5Q3UTQ8 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdkl5Q3UTQ8 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdkl5Q3UTQ8 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdkl5Q3UTQ8 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdkl5Q3UTQ8 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdkl5Q3UTQ8 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdkl5Q3UTQ8 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdkl5Q3UTQ8 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdkl5Q3UTQ8 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdkl5Q3UTQ8 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdkl5Q3UTQ8 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdkl5Q3UTQ8 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdkl5Q3UTQ8 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdkl5Q3UTQ8 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdkl5Q3UTQ8 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdkl5Q3UTQ8 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdkl5Q3UTQ8 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdkl5Q3UTQ8 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdkl5Q3UTQ8 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdkl5Q3UTQ8 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdkl5Q3UTQ8 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdkl5Q3UTQ8 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdkl5Q3UTQ8 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdkl5Q3UTQ8 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdkl5Q3UTQ8 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdkl5Q3UTQ8 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdkl5Q3UTQ8 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdkl5Q3UTQ8 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdkl5Q3UTQ8 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdkl5Q3UTQ8 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdkl5Q3UTQ8 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdkl5Q3UTQ8 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdkl5Q3UTQ8 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdkl5Q3UTQ8 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdkl5Q3UTQ8 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdkl5Q3UTQ8 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdkl5Q3UTQ8 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdkl5Q3UTQ8 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdkl5Q3UTQ8 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdkl5Q3UTQ8 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdkl5Q3UTQ8 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdkl5Q3UTQ8 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdkl5Q3UTQ8 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdkl5Q3UTQ8 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdkl5Q3UTQ8 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdkl5Q3UTQ8 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdkl5Q3UTQ8 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdkl5Q3UTQ8 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cdkl5Q3UTQ8 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cdkl5Q3UTQ8 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cdkl5Q3UTQ8 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdkl5Q3UTQ8 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdkl5Q3UTQ8 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdkl5Q3UTQ8 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdkl5Q3UTQ8 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdkl5Q3UTQ8 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdkl5Q3UTQ8 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdkl5Q3UTQ8 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdkl5Q3UTQ8 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdkl5Q3UTQ8 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdkl5Q3UTQ8 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdkl5Q3UTQ8 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdkl5Q3UTQ8 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdkl5Q3UTQ8 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdkl5Q3UTQ8 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdkl5Q3UTQ8 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdkl5Q3UTQ8 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdkl5Q3UTQ8 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdkl5Q3UTQ8 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdkl5Q3UTQ8 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdkl5Q3UTQ8 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdkl5Q3UTQ8 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdkl5Q3UTQ8 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdkl5Q3UTQ8 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdkl5Q3UTQ8 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdkl5Q3UTQ8 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms