Protein–RNA interactions for Protein: Q3USY0

Slc38a11, Putative sodium-coupled neutral amino acid transporter 11, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc38a11Q3USY0 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc38a11Q3USY0 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc38a11Q3USY0 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc38a11Q3USY0 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc38a11Q3USY0 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc38a11Q3USY0 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc38a11Q3USY0 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc38a11Q3USY0 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc38a11Q3USY0 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc38a11Q3USY0 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc38a11Q3USY0 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc38a11Q3USY0 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc38a11Q3USY0 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc38a11Q3USY0 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc38a11Q3USY0 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc38a11Q3USY0 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc38a11Q3USY0 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc38a11Q3USY0 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc38a11Q3USY0 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc38a11Q3USY0 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc38a11Q3USY0 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc38a11Q3USY0 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc38a11Q3USY0 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc38a11Q3USY0 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc38a11Q3USY0 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc38a11Q3USY0 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc38a11Q3USY0 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc38a11Q3USY0 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc38a11Q3USY0 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc38a11Q3USY0 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc38a11Q3USY0 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc38a11Q3USY0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc38a11Q3USY0 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc38a11Q3USY0 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc38a11Q3USY0 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc38a11Q3USY0 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc38a11Q3USY0 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc38a11Q3USY0 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc38a11Q3USY0 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc38a11Q3USY0 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc38a11Q3USY0 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc38a11Q3USY0 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc38a11Q3USY0 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc38a11Q3USY0 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc38a11Q3USY0 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc38a11Q3USY0 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc38a11Q3USY0 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc38a11Q3USY0 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc38a11Q3USY0 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc38a11Q3USY0 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc38a11Q3USY0 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc38a11Q3USY0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc38a11Q3USY0 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc38a11Q3USY0 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc38a11Q3USY0 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc38a11Q3USY0 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc38a11Q3USY0 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc38a11Q3USY0 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc38a11Q3USY0 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc38a11Q3USY0 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc38a11Q3USY0 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc38a11Q3USY0 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc38a11Q3USY0 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc38a11Q3USY0 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc38a11Q3USY0 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc38a11Q3USY0 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc38a11Q3USY0 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc38a11Q3USY0 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc38a11Q3USY0 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc38a11Q3USY0 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc38a11Q3USY0 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc38a11Q3USY0 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc38a11Q3USY0 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc38a11Q3USY0 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc38a11Q3USY0 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc38a11Q3USY0 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc38a11Q3USY0 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc38a11Q3USY0 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc38a11Q3USY0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc38a11Q3USY0 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc38a11Q3USY0 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc38a11Q3USY0 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc38a11Q3USY0 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc38a11Q3USY0 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc38a11Q3USY0 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc38a11Q3USY0 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc38a11Q3USY0 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc38a11Q3USY0 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc38a11Q3USY0 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc38a11Q3USY0 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc38a11Q3USY0 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc38a11Q3USY0 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc38a11Q3USY0 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc38a11Q3USY0 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc38a11Q3USY0 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc38a11Q3USY0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc38a11Q3USY0 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc38a11Q3USY0 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc38a11Q3USY0 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc38a11Q3USY0 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms