Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm28047Q3US59 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm28047Q3US59 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm28047Q3US59 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm28047Q3US59 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm28047Q3US59 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm28047Q3US59 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm28047Q3US59 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm28047Q3US59 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm28047Q3US59 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm28047Q3US59 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm28047Q3US59 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm28047Q3US59 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm28047Q3US59 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm28047Q3US59 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm28047Q3US59 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm28047Q3US59 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm28047Q3US59 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm28047Q3US59 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm28047Q3US59 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm28047Q3US59 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm28047Q3US59 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm28047Q3US59 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm28047Q3US59 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm28047Q3US59 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm28047Q3US59 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm28047Q3US59 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm28047Q3US59 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm28047Q3US59 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm28047Q3US59 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm28047Q3US59 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm28047Q3US59 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm28047Q3US59 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm28047Q3US59 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm28047Q3US59 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm28047Q3US59 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm28047Q3US59 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm28047Q3US59 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm28047Q3US59 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm28047Q3US59 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm28047Q3US59 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm28047Q3US59 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm28047Q3US59 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm28047Q3US59 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm28047Q3US59 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm28047Q3US59 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm28047Q3US59 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm28047Q3US59 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm28047Q3US59 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm28047Q3US59 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm28047Q3US59 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm28047Q3US59 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm28047Q3US59 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm28047Q3US59 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm28047Q3US59 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm28047Q3US59 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm28047Q3US59 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm28047Q3US59 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Gm28047Q3US59 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Gm28047Q3US59 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Gm28047Q3US59 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm28047Q3US59 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm28047Q3US59 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm28047Q3US59 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm28047Q3US59 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm28047Q3US59 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm28047Q3US59 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm28047Q3US59 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm28047Q3US59 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm28047Q3US59 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm28047Q3US59 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm28047Q3US59 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm28047Q3US59 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm28047Q3US59 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm28047Q3US59 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm28047Q3US59 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm28047Q3US59 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm28047Q3US59 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm28047Q3US59 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm28047Q3US59 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm28047Q3US59 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm28047Q3US59 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm28047Q3US59 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm28047Q3US59 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm28047Q3US59 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm28047Q3US59 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm28047Q3US59 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm28047Q3US59 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm28047Q3US59 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm28047Q3US59 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm28047Q3US59 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm28047Q3US59 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm28047Q3US59 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm28047Q3US59 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm28047Q3US59 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm28047Q3US59 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm28047Q3US59 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm28047Q3US59 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm28047Q3US59 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm28047Q3US59 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms