Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
D13Ertd608eQ3UPR8 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
D13Ertd608eQ3UPR8 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
D13Ertd608eQ3UPR8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
D13Ertd608eQ3UPR8 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
D13Ertd608eQ3UPR8 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
D13Ertd608eQ3UPR8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
D13Ertd608eQ3UPR8 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
D13Ertd608eQ3UPR8 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
D13Ertd608eQ3UPR8 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
D13Ertd608eQ3UPR8 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
D13Ertd608eQ3UPR8 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
D13Ertd608eQ3UPR8 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
D13Ertd608eQ3UPR8 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
D13Ertd608eQ3UPR8 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
D13Ertd608eQ3UPR8 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
D13Ertd608eQ3UPR8 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
D13Ertd608eQ3UPR8 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
D13Ertd608eQ3UPR8 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
D13Ertd608eQ3UPR8 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
D13Ertd608eQ3UPR8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
D13Ertd608eQ3UPR8 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
D13Ertd608eQ3UPR8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
D13Ertd608eQ3UPR8 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
D13Ertd608eQ3UPR8 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
D13Ertd608eQ3UPR8 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
D13Ertd608eQ3UPR8 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
D13Ertd608eQ3UPR8 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
D13Ertd608eQ3UPR8 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
D13Ertd608eQ3UPR8 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
D13Ertd608eQ3UPR8 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
D13Ertd608eQ3UPR8 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
D13Ertd608eQ3UPR8 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
D13Ertd608eQ3UPR8 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
D13Ertd608eQ3UPR8 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
D13Ertd608eQ3UPR8 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
D13Ertd608eQ3UPR8 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
D13Ertd608eQ3UPR8 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
D13Ertd608eQ3UPR8 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
D13Ertd608eQ3UPR8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
D13Ertd608eQ3UPR8 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
D13Ertd608eQ3UPR8 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms