Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP44

Nhlrc4, NHL-repeat-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc4Q3UP44 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Nhlrc4Q3UP44 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nhlrc4Q3UP44 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nhlrc4Q3UP44 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nhlrc4Q3UP44 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nhlrc4Q3UP44 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nhlrc4Q3UP44 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nhlrc4Q3UP44 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nhlrc4Q3UP44 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Nhlrc4Q3UP44 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nhlrc4Q3UP44 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nhlrc4Q3UP44 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nhlrc4Q3UP44 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nhlrc4Q3UP44 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nhlrc4Q3UP44 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nhlrc4Q3UP44 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Nhlrc4Q3UP44 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nhlrc4Q3UP44 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nhlrc4Q3UP44 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nhlrc4Q3UP44 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Nhlrc4Q3UP44 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nhlrc4Q3UP44 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Nhlrc4Q3UP44 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nhlrc4Q3UP44 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nhlrc4Q3UP44 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nhlrc4Q3UP44 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nhlrc4Q3UP44 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Nhlrc4Q3UP44 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nhlrc4Q3UP44 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nhlrc4Q3UP44 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nhlrc4Q3UP44 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nhlrc4Q3UP44 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nhlrc4Q3UP44 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nhlrc4Q3UP44 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nhlrc4Q3UP44 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nhlrc4Q3UP44 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nhlrc4Q3UP44 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nhlrc4Q3UP44 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nhlrc4Q3UP44 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Nhlrc4Q3UP44 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nhlrc4Q3UP44 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nhlrc4Q3UP44 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nhlrc4Q3UP44 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nhlrc4Q3UP44 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nhlrc4Q3UP44 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nhlrc4Q3UP44 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nhlrc4Q3UP44 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nhlrc4Q3UP44 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nhlrc4Q3UP44 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nhlrc4Q3UP44 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nhlrc4Q3UP44 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nhlrc4Q3UP44 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nhlrc4Q3UP44 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nhlrc4Q3UP44 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nhlrc4Q3UP44 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nhlrc4Q3UP44 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nhlrc4Q3UP44 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nhlrc4Q3UP44 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nhlrc4Q3UP44 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nhlrc4Q3UP44 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nhlrc4Q3UP44 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nhlrc4Q3UP44 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nhlrc4Q3UP44 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nhlrc4Q3UP44 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nhlrc4Q3UP44 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nhlrc4Q3UP44 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nhlrc4Q3UP44 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nhlrc4Q3UP44 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nhlrc4Q3UP44 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nhlrc4Q3UP44 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nhlrc4Q3UP44 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nhlrc4Q3UP44 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nhlrc4Q3UP44 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Nhlrc4Q3UP44 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nhlrc4Q3UP44 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nhlrc4Q3UP44 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Nhlrc4Q3UP44 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Nhlrc4Q3UP44 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Nhlrc4Q3UP44 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nhlrc4Q3UP44 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nhlrc4Q3UP44 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nhlrc4Q3UP44 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nhlrc4Q3UP44 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nhlrc4Q3UP44 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nhlrc4Q3UP44 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Nhlrc4Q3UP44 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nhlrc4Q3UP44 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nhlrc4Q3UP44 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nhlrc4Q3UP44 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nhlrc4Q3UP44 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nhlrc4Q3UP44 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Nhlrc4Q3UP44 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nhlrc4Q3UP44 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nhlrc4Q3UP44 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nhlrc4Q3UP44 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nhlrc4Q3UP44 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nhlrc4Q3UP44 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nhlrc4Q3UP44 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nhlrc4Q3UP44 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nhlrc4Q3UP44 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms