Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM18

Lsg1, Large subunit GTPase 1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsg1Q3UM18 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lsg1Q3UM18 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lsg1Q3UM18 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lsg1Q3UM18 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lsg1Q3UM18 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lsg1Q3UM18 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lsg1Q3UM18 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Lsg1Q3UM18 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Lsg1Q3UM18 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lsg1Q3UM18 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lsg1Q3UM18 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lsg1Q3UM18 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Lsg1Q3UM18 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lsg1Q3UM18 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lsg1Q3UM18 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lsg1Q3UM18 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lsg1Q3UM18 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lsg1Q3UM18 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lsg1Q3UM18 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lsg1Q3UM18 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lsg1Q3UM18 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lsg1Q3UM18 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lsg1Q3UM18 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lsg1Q3UM18 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lsg1Q3UM18 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lsg1Q3UM18 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lsg1Q3UM18 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lsg1Q3UM18 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lsg1Q3UM18 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lsg1Q3UM18 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Lsg1Q3UM18 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lsg1Q3UM18 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lsg1Q3UM18 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lsg1Q3UM18 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lsg1Q3UM18 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lsg1Q3UM18 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lsg1Q3UM18 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lsg1Q3UM18 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lsg1Q3UM18 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lsg1Q3UM18 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lsg1Q3UM18 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lsg1Q3UM18 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lsg1Q3UM18 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lsg1Q3UM18 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lsg1Q3UM18 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lsg1Q3UM18 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lsg1Q3UM18 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lsg1Q3UM18 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lsg1Q3UM18 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lsg1Q3UM18 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lsg1Q3UM18 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lsg1Q3UM18 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lsg1Q3UM18 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lsg1Q3UM18 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lsg1Q3UM18 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lsg1Q3UM18 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lsg1Q3UM18 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lsg1Q3UM18 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lsg1Q3UM18 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lsg1Q3UM18 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lsg1Q3UM18 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lsg1Q3UM18 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lsg1Q3UM18 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lsg1Q3UM18 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lsg1Q3UM18 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lsg1Q3UM18 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lsg1Q3UM18 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lsg1Q3UM18 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lsg1Q3UM18 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lsg1Q3UM18 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lsg1Q3UM18 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lsg1Q3UM18 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lsg1Q3UM18 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lsg1Q3UM18 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lsg1Q3UM18 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lsg1Q3UM18 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lsg1Q3UM18 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lsg1Q3UM18 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lsg1Q3UM18 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lsg1Q3UM18 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lsg1Q3UM18 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lsg1Q3UM18 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lsg1Q3UM18 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lsg1Q3UM18 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lsg1Q3UM18 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lsg1Q3UM18 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lsg1Q3UM18 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lsg1Q3UM18 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lsg1Q3UM18 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lsg1Q3UM18 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lsg1Q3UM18 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lsg1Q3UM18 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lsg1Q3UM18 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Lsg1Q3UM18 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lsg1Q3UM18 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lsg1Q3UM18 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lsg1Q3UM18 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lsg1Q3UM18 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lsg1Q3UM18 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lsg1Q3UM18 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms