Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc33Q3ULW6 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc33Q3ULW6 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc33Q3ULW6 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc33Q3ULW6 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc33Q3ULW6 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc33Q3ULW6 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc33Q3ULW6 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc33Q3ULW6 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc33Q3ULW6 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc33Q3ULW6 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc33Q3ULW6 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc33Q3ULW6 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc33Q3ULW6 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc33Q3ULW6 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc33Q3ULW6 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc33Q3ULW6 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc33Q3ULW6 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc33Q3ULW6 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc33Q3ULW6 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc33Q3ULW6 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc33Q3ULW6 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc33Q3ULW6 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc33Q3ULW6 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc33Q3ULW6 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc33Q3ULW6 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc33Q3ULW6 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc33Q3ULW6 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc33Q3ULW6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc33Q3ULW6 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc33Q3ULW6 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc33Q3ULW6 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc33Q3ULW6 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc33Q3ULW6 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc33Q3ULW6 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc33Q3ULW6 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc33Q3ULW6 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc33Q3ULW6 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc33Q3ULW6 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc33Q3ULW6 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc33Q3ULW6 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc33Q3ULW6 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc33Q3ULW6 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc33Q3ULW6 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc33Q3ULW6 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc33Q3ULW6 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc33Q3ULW6 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc33Q3ULW6 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc33Q3ULW6 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc33Q3ULW6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc33Q3ULW6 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc33Q3ULW6 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc33Q3ULW6 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc33Q3ULW6 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc33Q3ULW6 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc33Q3ULW6 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc33Q3ULW6 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc33Q3ULW6 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc33Q3ULW6 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc33Q3ULW6 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc33Q3ULW6 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc33Q3ULW6 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc33Q3ULW6 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc33Q3ULW6 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc33Q3ULW6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc33Q3ULW6 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc33Q3ULW6 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc33Q3ULW6 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc33Q3ULW6 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc33Q3ULW6 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc33Q3ULW6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc33Q3ULW6 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc33Q3ULW6 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc33Q3ULW6 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc33Q3ULW6 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc33Q3ULW6 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc33Q3ULW6 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc33Q3ULW6 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc33Q3ULW6 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc33Q3ULW6 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc33Q3ULW6 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc33Q3ULW6 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ccdc33Q3ULW6 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc33Q3ULW6 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc33Q3ULW6 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc33Q3ULW6 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc33Q3ULW6 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc33Q3ULW6 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc33Q3ULW6 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc33Q3ULW6 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc33Q3ULW6 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc33Q3ULW6 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc33Q3ULW6 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc33Q3ULW6 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc33Q3ULW6 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc33Q3ULW6 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc33Q3ULW6 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc33Q3ULW6 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc33Q3ULW6 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc33Q3ULW6 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms