Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHK3

Greb1, Protein GREB1, mousemouse

Predictions only

Length 1,954 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Greb1Q3UHK3 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Greb1Q3UHK3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Greb1Q3UHK3 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Greb1Q3UHK3 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Greb1Q3UHK3 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Greb1Q3UHK3 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Greb1Q3UHK3 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Greb1Q3UHK3 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Greb1Q3UHK3 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Greb1Q3UHK3 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Greb1Q3UHK3 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Greb1Q3UHK3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Greb1Q3UHK3 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Greb1Q3UHK3 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Greb1Q3UHK3 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Greb1Q3UHK3 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Greb1Q3UHK3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Greb1Q3UHK3 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Greb1Q3UHK3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Greb1Q3UHK3 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Greb1Q3UHK3 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Greb1Q3UHK3 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Greb1Q3UHK3 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Greb1Q3UHK3 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Greb1Q3UHK3 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Greb1Q3UHK3 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Greb1Q3UHK3 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Greb1Q3UHK3 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Greb1Q3UHK3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Greb1Q3UHK3 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Greb1Q3UHK3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Greb1Q3UHK3 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Greb1Q3UHK3 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Greb1Q3UHK3 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Greb1Q3UHK3 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Greb1Q3UHK3 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Greb1Q3UHK3 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Greb1Q3UHK3 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Greb1Q3UHK3 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Greb1Q3UHK3 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Greb1Q3UHK3 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Greb1Q3UHK3 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Greb1Q3UHK3 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Greb1Q3UHK3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Greb1Q3UHK3 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Greb1Q3UHK3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Greb1Q3UHK3 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Greb1Q3UHK3 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Greb1Q3UHK3 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Greb1Q3UHK3 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Greb1Q3UHK3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Greb1Q3UHK3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Greb1Q3UHK3 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Greb1Q3UHK3 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Greb1Q3UHK3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Greb1Q3UHK3 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Greb1Q3UHK3 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Greb1Q3UHK3 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Greb1Q3UHK3 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Greb1Q3UHK3 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Greb1Q3UHK3 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Greb1Q3UHK3 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Greb1Q3UHK3 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Greb1Q3UHK3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Greb1Q3UHK3 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Greb1Q3UHK3 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Greb1Q3UHK3 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Greb1Q3UHK3 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Greb1Q3UHK3 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Greb1Q3UHK3 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Greb1Q3UHK3 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Greb1Q3UHK3 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Greb1Q3UHK3 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Greb1Q3UHK3 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Greb1Q3UHK3 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Greb1Q3UHK3 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Greb1Q3UHK3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Greb1Q3UHK3 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Greb1Q3UHK3 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Greb1Q3UHK3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Greb1Q3UHK3 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Greb1Q3UHK3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Greb1Q3UHK3 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Greb1Q3UHK3 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Greb1Q3UHK3 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Greb1Q3UHK3 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Greb1Q3UHK3 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Greb1Q3UHK3 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Greb1Q3UHK3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Greb1Q3UHK3 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Greb1Q3UHK3 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Greb1Q3UHK3 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Greb1Q3UHK3 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Greb1Q3UHK3 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Greb1Q3UHK3 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Greb1Q3UHK3 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Greb1Q3UHK3 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Greb1Q3UHK3 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Greb1Q3UHK3 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Greb1Q3UHK3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms