Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHC0

Tnrc6c, Trinucleotide repeat-containing gene 6C protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnrc6cQ3UHC0 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tnrc6cQ3UHC0 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tnrc6cQ3UHC0 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Tnrc6cQ3UHC0 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tnrc6cQ3UHC0 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tnrc6cQ3UHC0 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tnrc6cQ3UHC0 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tnrc6cQ3UHC0 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tnrc6cQ3UHC0 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tnrc6cQ3UHC0 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tnrc6cQ3UHC0 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tnrc6cQ3UHC0 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tnrc6cQ3UHC0 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tnrc6cQ3UHC0 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tnrc6cQ3UHC0 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tnrc6cQ3UHC0 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tnrc6cQ3UHC0 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tnrc6cQ3UHC0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tnrc6cQ3UHC0 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tnrc6cQ3UHC0 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Tnrc6cQ3UHC0 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tnrc6cQ3UHC0 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tnrc6cQ3UHC0 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tnrc6cQ3UHC0 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tnrc6cQ3UHC0 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tnrc6cQ3UHC0 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tnrc6cQ3UHC0 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Tnrc6cQ3UHC0 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tnrc6cQ3UHC0 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tnrc6cQ3UHC0 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tnrc6cQ3UHC0 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tnrc6cQ3UHC0 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tnrc6cQ3UHC0 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tnrc6cQ3UHC0 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tnrc6cQ3UHC0 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tnrc6cQ3UHC0 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tnrc6cQ3UHC0 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tnrc6cQ3UHC0 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Tnrc6cQ3UHC0 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tnrc6cQ3UHC0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tnrc6cQ3UHC0 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tnrc6cQ3UHC0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tnrc6cQ3UHC0 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Tnrc6cQ3UHC0 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tnrc6cQ3UHC0 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tnrc6cQ3UHC0 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tnrc6cQ3UHC0 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tnrc6cQ3UHC0 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tnrc6cQ3UHC0 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tnrc6cQ3UHC0 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Tnrc6cQ3UHC0 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tnrc6cQ3UHC0 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tnrc6cQ3UHC0 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tnrc6cQ3UHC0 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tnrc6cQ3UHC0 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Tnrc6cQ3UHC0 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tnrc6cQ3UHC0 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tnrc6cQ3UHC0 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tnrc6cQ3UHC0 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tnrc6cQ3UHC0 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tnrc6cQ3UHC0 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tnrc6cQ3UHC0 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tnrc6cQ3UHC0 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tnrc6cQ3UHC0 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tnrc6cQ3UHC0 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tnrc6cQ3UHC0 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tnrc6cQ3UHC0 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tnrc6cQ3UHC0 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tnrc6cQ3UHC0 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tnrc6cQ3UHC0 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tnrc6cQ3UHC0 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tnrc6cQ3UHC0 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tnrc6cQ3UHC0 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tnrc6cQ3UHC0 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tnrc6cQ3UHC0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tnrc6cQ3UHC0 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tnrc6cQ3UHC0 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tnrc6cQ3UHC0 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tnrc6cQ3UHC0 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tnrc6cQ3UHC0 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tnrc6cQ3UHC0 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tnrc6cQ3UHC0 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tnrc6cQ3UHC0 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tnrc6cQ3UHC0 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tnrc6cQ3UHC0 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tnrc6cQ3UHC0 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tnrc6cQ3UHC0 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tnrc6cQ3UHC0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tnrc6cQ3UHC0 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tnrc6cQ3UHC0 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tnrc6cQ3UHC0 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tnrc6cQ3UHC0 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tnrc6cQ3UHC0 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Tnrc6cQ3UHC0 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tnrc6cQ3UHC0 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tnrc6cQ3UHC0 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tnrc6cQ3UHC0 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tnrc6cQ3UHC0 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tnrc6cQ3UHC0 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tnrc6cQ3UHC0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms