Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFY4

Rsph3a, Radial spoke head protein 3 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph3aQ3UFY4 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Rsph3aQ3UFY4 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rsph3aQ3UFY4 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rsph3aQ3UFY4 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rsph3aQ3UFY4 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rsph3aQ3UFY4 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rsph3aQ3UFY4 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rsph3aQ3UFY4 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rsph3aQ3UFY4 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rsph3aQ3UFY4 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rsph3aQ3UFY4 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rsph3aQ3UFY4 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rsph3aQ3UFY4 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rsph3aQ3UFY4 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rsph3aQ3UFY4 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rsph3aQ3UFY4 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rsph3aQ3UFY4 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rsph3aQ3UFY4 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rsph3aQ3UFY4 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rsph3aQ3UFY4 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rsph3aQ3UFY4 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rsph3aQ3UFY4 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rsph3aQ3UFY4 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rsph3aQ3UFY4 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rsph3aQ3UFY4 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rsph3aQ3UFY4 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rsph3aQ3UFY4 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rsph3aQ3UFY4 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Rsph3aQ3UFY4 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rsph3aQ3UFY4 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rsph3aQ3UFY4 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rsph3aQ3UFY4 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rsph3aQ3UFY4 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rsph3aQ3UFY4 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rsph3aQ3UFY4 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rsph3aQ3UFY4 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rsph3aQ3UFY4 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rsph3aQ3UFY4 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rsph3aQ3UFY4 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rsph3aQ3UFY4 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rsph3aQ3UFY4 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rsph3aQ3UFY4 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rsph3aQ3UFY4 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rsph3aQ3UFY4 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rsph3aQ3UFY4 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rsph3aQ3UFY4 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rsph3aQ3UFY4 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rsph3aQ3UFY4 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rsph3aQ3UFY4 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rsph3aQ3UFY4 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rsph3aQ3UFY4 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rsph3aQ3UFY4 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rsph3aQ3UFY4 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rsph3aQ3UFY4 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rsph3aQ3UFY4 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rsph3aQ3UFY4 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rsph3aQ3UFY4 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rsph3aQ3UFY4 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rsph3aQ3UFY4 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rsph3aQ3UFY4 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rsph3aQ3UFY4 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rsph3aQ3UFY4 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rsph3aQ3UFY4 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rsph3aQ3UFY4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rsph3aQ3UFY4 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Rsph3aQ3UFY4 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rsph3aQ3UFY4 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rsph3aQ3UFY4 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rsph3aQ3UFY4 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rsph3aQ3UFY4 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rsph3aQ3UFY4 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rsph3aQ3UFY4 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rsph3aQ3UFY4 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rsph3aQ3UFY4 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rsph3aQ3UFY4 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rsph3aQ3UFY4 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rsph3aQ3UFY4 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rsph3aQ3UFY4 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rsph3aQ3UFY4 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rsph3aQ3UFY4 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rsph3aQ3UFY4 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rsph3aQ3UFY4 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rsph3aQ3UFY4 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rsph3aQ3UFY4 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rsph3aQ3UFY4 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rsph3aQ3UFY4 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rsph3aQ3UFY4 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rsph3aQ3UFY4 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rsph3aQ3UFY4 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rsph3aQ3UFY4 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rsph3aQ3UFY4 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rsph3aQ3UFY4 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rsph3aQ3UFY4 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rsph3aQ3UFY4 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rsph3aQ3UFY4 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Rsph3aQ3UFY4 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rsph3aQ3UFY4 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rsph3aQ3UFY4 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Rsph3aQ3UFY4 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rsph3aQ3UFY4 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms