Protein–RNA interactions for Protein: Q3UF64

Rnft2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft2Q3UF64 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnft2Q3UF64 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnft2Q3UF64 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnft2Q3UF64 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnft2Q3UF64 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnft2Q3UF64 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnft2Q3UF64 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnft2Q3UF64 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnft2Q3UF64 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnft2Q3UF64 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnft2Q3UF64 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnft2Q3UF64 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnft2Q3UF64 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnft2Q3UF64 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnft2Q3UF64 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnft2Q3UF64 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnft2Q3UF64 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnft2Q3UF64 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnft2Q3UF64 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnft2Q3UF64 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnft2Q3UF64 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnft2Q3UF64 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnft2Q3UF64 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnft2Q3UF64 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnft2Q3UF64 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnft2Q3UF64 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnft2Q3UF64 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnft2Q3UF64 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnft2Q3UF64 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnft2Q3UF64 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnft2Q3UF64 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnft2Q3UF64 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnft2Q3UF64 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnft2Q3UF64 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnft2Q3UF64 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnft2Q3UF64 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnft2Q3UF64 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnft2Q3UF64 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnft2Q3UF64 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnft2Q3UF64 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnft2Q3UF64 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnft2Q3UF64 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnft2Q3UF64 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnft2Q3UF64 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnft2Q3UF64 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnft2Q3UF64 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnft2Q3UF64 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnft2Q3UF64 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnft2Q3UF64 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnft2Q3UF64 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnft2Q3UF64 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnft2Q3UF64 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnft2Q3UF64 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnft2Q3UF64 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnft2Q3UF64 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnft2Q3UF64 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnft2Q3UF64 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnft2Q3UF64 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnft2Q3UF64 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnft2Q3UF64 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnft2Q3UF64 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnft2Q3UF64 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnft2Q3UF64 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnft2Q3UF64 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnft2Q3UF64 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnft2Q3UF64 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnft2Q3UF64 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnft2Q3UF64 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnft2Q3UF64 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnft2Q3UF64 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnft2Q3UF64 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnft2Q3UF64 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnft2Q3UF64 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnft2Q3UF64 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnft2Q3UF64 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnft2Q3UF64 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnft2Q3UF64 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Rnft2Q3UF64 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Rnft2Q3UF64 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnft2Q3UF64 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnft2Q3UF64 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnft2Q3UF64 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnft2Q3UF64 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnft2Q3UF64 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnft2Q3UF64 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnft2Q3UF64 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnft2Q3UF64 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnft2Q3UF64 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnft2Q3UF64 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnft2Q3UF64 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnft2Q3UF64 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnft2Q3UF64 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnft2Q3UF64 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnft2Q3UF64 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnft2Q3UF64 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnft2Q3UF64 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnft2Q3UF64 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnft2Q3UF64 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnft2Q3UF64 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnft2Q3UF64 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms