Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDE2

Ttll12, Tubulin--tyrosine ligase-like protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll12Q3UDE2 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ttll12Q3UDE2 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ttll12Q3UDE2 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ttll12Q3UDE2 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ttll12Q3UDE2 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ttll12Q3UDE2 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ttll12Q3UDE2 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ttll12Q3UDE2 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ttll12Q3UDE2 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ttll12Q3UDE2 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ttll12Q3UDE2 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ttll12Q3UDE2 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ttll12Q3UDE2 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ttll12Q3UDE2 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ttll12Q3UDE2 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ttll12Q3UDE2 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ttll12Q3UDE2 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ttll12Q3UDE2 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ttll12Q3UDE2 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ttll12Q3UDE2 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ttll12Q3UDE2 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ttll12Q3UDE2 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ttll12Q3UDE2 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ttll12Q3UDE2 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ttll12Q3UDE2 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ttll12Q3UDE2 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ttll12Q3UDE2 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ttll12Q3UDE2 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ttll12Q3UDE2 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ttll12Q3UDE2 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ttll12Q3UDE2 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ttll12Q3UDE2 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ttll12Q3UDE2 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ttll12Q3UDE2 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ttll12Q3UDE2 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ttll12Q3UDE2 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ttll12Q3UDE2 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ttll12Q3UDE2 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ttll12Q3UDE2 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Ttll12Q3UDE2 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Ttll12Q3UDE2 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ttll12Q3UDE2 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ttll12Q3UDE2 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ttll12Q3UDE2 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ttll12Q3UDE2 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ttll12Q3UDE2 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ttll12Q3UDE2 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ttll12Q3UDE2 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ttll12Q3UDE2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ttll12Q3UDE2 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ttll12Q3UDE2 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ttll12Q3UDE2 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ttll12Q3UDE2 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ttll12Q3UDE2 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ttll12Q3UDE2 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ttll12Q3UDE2 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ttll12Q3UDE2 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ttll12Q3UDE2 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ttll12Q3UDE2 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ttll12Q3UDE2 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ttll12Q3UDE2 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ttll12Q3UDE2 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ttll12Q3UDE2 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ttll12Q3UDE2 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ttll12Q3UDE2 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ttll12Q3UDE2 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ttll12Q3UDE2 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ttll12Q3UDE2 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ttll12Q3UDE2 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ttll12Q3UDE2 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ttll12Q3UDE2 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ttll12Q3UDE2 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ttll12Q3UDE2 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ttll12Q3UDE2 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ttll12Q3UDE2 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ttll12Q3UDE2 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ttll12Q3UDE2 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ttll12Q3UDE2 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ttll12Q3UDE2 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ttll12Q3UDE2 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ttll12Q3UDE2 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ttll12Q3UDE2 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ttll12Q3UDE2 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ttll12Q3UDE2 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ttll12Q3UDE2 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Ttll12Q3UDE2 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Ttll12Q3UDE2 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ttll12Q3UDE2 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ttll12Q3UDE2 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ttll12Q3UDE2 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ttll12Q3UDE2 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ttll12Q3UDE2 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ttll12Q3UDE2 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ttll12Q3UDE2 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ttll12Q3UDE2 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ttll12Q3UDE2 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ttll12Q3UDE2 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ttll12Q3UDE2 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ttll12Q3UDE2 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ttll12Q3UDE2 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms