Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gtpbp6Q3U6U5 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gtpbp6Q3U6U5 Clec4d-201ENSMUST00000032240 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gtpbp6Q3U6U5 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gtpbp6Q3U6U5 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gtpbp6Q3U6U5 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gtpbp6Q3U6U5 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Gtpbp6Q3U6U5 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Gtpbp6Q3U6U5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gtpbp6Q3U6U5 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gtpbp6Q3U6U5 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gtpbp6Q3U6U5 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gtpbp6Q3U6U5 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gtpbp6Q3U6U5 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gtpbp6Q3U6U5 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gtpbp6Q3U6U5 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gtpbp6Q3U6U5 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gtpbp6Q3U6U5 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gtpbp6Q3U6U5 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gtpbp6Q3U6U5 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gtpbp6Q3U6U5 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gtpbp6Q3U6U5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gtpbp6Q3U6U5 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gtpbp6Q3U6U5 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gtpbp6Q3U6U5 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gtpbp6Q3U6U5 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gtpbp6Q3U6U5 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gtpbp6Q3U6U5 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gtpbp6Q3U6U5 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gtpbp6Q3U6U5 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Gtpbp6Q3U6U5 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Gtpbp6Q3U6U5 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gtpbp6Q3U6U5 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gtpbp6Q3U6U5 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gtpbp6Q3U6U5 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gtpbp6Q3U6U5 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gtpbp6Q3U6U5 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gtpbp6Q3U6U5 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gtpbp6Q3U6U5 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gtpbp6Q3U6U5 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Gtpbp6Q3U6U5 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gtpbp6Q3U6U5 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gtpbp6Q3U6U5 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gtpbp6Q3U6U5 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gtpbp6Q3U6U5 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gtpbp6Q3U6U5 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gtpbp6Q3U6U5 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gtpbp6Q3U6U5 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gtpbp6Q3U6U5 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gtpbp6Q3U6U5 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gtpbp6Q3U6U5 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gtpbp6Q3U6U5 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Gtpbp6Q3U6U5 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gtpbp6Q3U6U5 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gtpbp6Q3U6U5 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gtpbp6Q3U6U5 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gtpbp6Q3U6U5 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gtpbp6Q3U6U5 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Gtpbp6Q3U6U5 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Gtpbp6Q3U6U5 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gtpbp6Q3U6U5 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gtpbp6Q3U6U5 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gtpbp6Q3U6U5 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gtpbp6Q3U6U5 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gtpbp6Q3U6U5 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gtpbp6Q3U6U5 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gtpbp6Q3U6U5 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gtpbp6Q3U6U5 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gtpbp6Q3U6U5 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gtpbp6Q3U6U5 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gtpbp6Q3U6U5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gtpbp6Q3U6U5 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gtpbp6Q3U6U5 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gtpbp6Q3U6U5 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Gtpbp6Q3U6U5 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gtpbp6Q3U6U5 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gtpbp6Q3U6U5 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gtpbp6Q3U6U5 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gtpbp6Q3U6U5 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gtpbp6Q3U6U5 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gtpbp6Q3U6U5 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gtpbp6Q3U6U5 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gtpbp6Q3U6U5 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gtpbp6Q3U6U5 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gtpbp6Q3U6U5 Gm32390-201ENSMUST00000212713 1172 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Gtpbp6Q3U6U5 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gtpbp6Q3U6U5 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms