Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

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Length 105 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q3U595 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q3U595 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q3U595 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q3U595 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q3U595 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q3U595 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q3U595 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q3U595 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q3U595 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Q3U595 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q3U595 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Q3U595 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q3U595 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q3U595 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q3U595 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q3U595 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q3U595 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q3U595 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3U595 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3U595 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3U595 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3U595 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3U595 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3U595 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3U595 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3U595 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3U595 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3U595 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3U595 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3U595 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3U595 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3U595 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3U595 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3U595 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3U595 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3U595 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3U595 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3U595 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3U595 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3U595 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3U595 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3U595 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3U595 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3U595 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3U595 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3U595 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3U595 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3U595 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3U595 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3U595 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3U595 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3U595 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3U595 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3U595 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3U595 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3U595 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3U595 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3U595 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3U595 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3U595 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3U595 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3U595 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3U595 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3U595 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3U595 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3U595 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3U595 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3U595 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3U595 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3U595 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3U595 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3U595 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3U595 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3U595 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3U595 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3U595 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3U595 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3U595 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3U595 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3U595 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3U595 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3U595 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3U595 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3U595 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3U595 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3U595 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3U595 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3U595 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3U595 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3U595 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3U595 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3U595 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3U595 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3U595 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3U595 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3U595 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3U595 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3U595 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3U595 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms