Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssbp4Q3U4B1 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssbp4Q3U4B1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssbp4Q3U4B1 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssbp4Q3U4B1 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssbp4Q3U4B1 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssbp4Q3U4B1 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssbp4Q3U4B1 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssbp4Q3U4B1 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssbp4Q3U4B1 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssbp4Q3U4B1 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssbp4Q3U4B1 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssbp4Q3U4B1 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssbp4Q3U4B1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssbp4Q3U4B1 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssbp4Q3U4B1 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssbp4Q3U4B1 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssbp4Q3U4B1 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssbp4Q3U4B1 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssbp4Q3U4B1 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssbp4Q3U4B1 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssbp4Q3U4B1 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssbp4Q3U4B1 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssbp4Q3U4B1 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssbp4Q3U4B1 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssbp4Q3U4B1 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssbp4Q3U4B1 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssbp4Q3U4B1 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssbp4Q3U4B1 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssbp4Q3U4B1 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssbp4Q3U4B1 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssbp4Q3U4B1 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssbp4Q3U4B1 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssbp4Q3U4B1 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssbp4Q3U4B1 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssbp4Q3U4B1 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssbp4Q3U4B1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssbp4Q3U4B1 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssbp4Q3U4B1 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssbp4Q3U4B1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssbp4Q3U4B1 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssbp4Q3U4B1 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssbp4Q3U4B1 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssbp4Q3U4B1 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssbp4Q3U4B1 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssbp4Q3U4B1 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssbp4Q3U4B1 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssbp4Q3U4B1 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssbp4Q3U4B1 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssbp4Q3U4B1 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssbp4Q3U4B1 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssbp4Q3U4B1 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssbp4Q3U4B1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssbp4Q3U4B1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssbp4Q3U4B1 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssbp4Q3U4B1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssbp4Q3U4B1 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssbp4Q3U4B1 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssbp4Q3U4B1 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssbp4Q3U4B1 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssbp4Q3U4B1 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssbp4Q3U4B1 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssbp4Q3U4B1 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssbp4Q3U4B1 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssbp4Q3U4B1 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssbp4Q3U4B1 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ssbp4Q3U4B1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ssbp4Q3U4B1 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ssbp4Q3U4B1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ssbp4Q3U4B1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ssbp4Q3U4B1 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssbp4Q3U4B1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssbp4Q3U4B1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssbp4Q3U4B1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssbp4Q3U4B1 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssbp4Q3U4B1 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssbp4Q3U4B1 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssbp4Q3U4B1 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssbp4Q3U4B1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssbp4Q3U4B1 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssbp4Q3U4B1 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssbp4Q3U4B1 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssbp4Q3U4B1 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssbp4Q3U4B1 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssbp4Q3U4B1 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssbp4Q3U4B1 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ssbp4Q3U4B1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssbp4Q3U4B1 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssbp4Q3U4B1 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ssbp4Q3U4B1 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ssbp4Q3U4B1 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssbp4Q3U4B1 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssbp4Q3U4B1 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssbp4Q3U4B1 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssbp4Q3U4B1 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssbp4Q3U4B1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssbp4Q3U4B1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssbp4Q3U4B1 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssbp4Q3U4B1 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssbp4Q3U4B1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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