Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S4

Otud5, OTU domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud5Q3U2S4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Otud5Q3U2S4 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Otud5Q3U2S4 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Otud5Q3U2S4 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Otud5Q3U2S4 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Otud5Q3U2S4 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Otud5Q3U2S4 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Otud5Q3U2S4 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Otud5Q3U2S4 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Otud5Q3U2S4 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Otud5Q3U2S4 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Otud5Q3U2S4 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Otud5Q3U2S4 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Otud5Q3U2S4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Otud5Q3U2S4 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Otud5Q3U2S4 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Otud5Q3U2S4 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Otud5Q3U2S4 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Otud5Q3U2S4 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Otud5Q3U2S4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Otud5Q3U2S4 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Otud5Q3U2S4 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Otud5Q3U2S4 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Otud5Q3U2S4 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Otud5Q3U2S4 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Otud5Q3U2S4 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Otud5Q3U2S4 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Otud5Q3U2S4 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Otud5Q3U2S4 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Otud5Q3U2S4 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Otud5Q3U2S4 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Otud5Q3U2S4 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Otud5Q3U2S4 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Otud5Q3U2S4 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Otud5Q3U2S4 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Otud5Q3U2S4 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Otud5Q3U2S4 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Otud5Q3U2S4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Otud5Q3U2S4 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Otud5Q3U2S4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Otud5Q3U2S4 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Otud5Q3U2S4 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Otud5Q3U2S4 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Otud5Q3U2S4 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Otud5Q3U2S4 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Otud5Q3U2S4 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Otud5Q3U2S4 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Otud5Q3U2S4 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Otud5Q3U2S4 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Otud5Q3U2S4 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Otud5Q3U2S4 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Otud5Q3U2S4 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Otud5Q3U2S4 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Otud5Q3U2S4 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Otud5Q3U2S4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Otud5Q3U2S4 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Otud5Q3U2S4 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Otud5Q3U2S4 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Otud5Q3U2S4 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Otud5Q3U2S4 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Otud5Q3U2S4 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Otud5Q3U2S4 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Otud5Q3U2S4 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Otud5Q3U2S4 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Otud5Q3U2S4 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Otud5Q3U2S4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Otud5Q3U2S4 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Otud5Q3U2S4 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Otud5Q3U2S4 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Otud5Q3U2S4 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Otud5Q3U2S4 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Otud5Q3U2S4 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Otud5Q3U2S4 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Otud5Q3U2S4 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Otud5Q3U2S4 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Otud5Q3U2S4 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Otud5Q3U2S4 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Otud5Q3U2S4 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Otud5Q3U2S4 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Otud5Q3U2S4 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Otud5Q3U2S4 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Otud5Q3U2S4 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Otud5Q3U2S4 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Otud5Q3U2S4 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Otud5Q3U2S4 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Otud5Q3U2S4 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Otud5Q3U2S4 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Otud5Q3U2S4 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Otud5Q3U2S4 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Otud5Q3U2S4 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Otud5Q3U2S4 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Otud5Q3U2S4 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Otud5Q3U2S4 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Otud5Q3U2S4 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Otud5Q3U2S4 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Otud5Q3U2S4 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Otud5Q3U2S4 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Otud5Q3U2S4 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Otud5Q3U2S4 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Otud5Q3U2S4 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms