Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Trappc9Q3U0M1 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trappc9Q3U0M1 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trappc9Q3U0M1 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trappc9Q3U0M1 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Trappc9Q3U0M1 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trappc9Q3U0M1 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trappc9Q3U0M1 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trappc9Q3U0M1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trappc9Q3U0M1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trappc9Q3U0M1 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trappc9Q3U0M1 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Trappc9Q3U0M1 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trappc9Q3U0M1 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trappc9Q3U0M1 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trappc9Q3U0M1 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trappc9Q3U0M1 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trappc9Q3U0M1 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trappc9Q3U0M1 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trappc9Q3U0M1 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trappc9Q3U0M1 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trappc9Q3U0M1 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trappc9Q3U0M1 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trappc9Q3U0M1 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trappc9Q3U0M1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trappc9Q3U0M1 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trappc9Q3U0M1 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Trappc9Q3U0M1 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trappc9Q3U0M1 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trappc9Q3U0M1 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trappc9Q3U0M1 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trappc9Q3U0M1 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trappc9Q3U0M1 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trappc9Q3U0M1 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trappc9Q3U0M1 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trappc9Q3U0M1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trappc9Q3U0M1 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trappc9Q3U0M1 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trappc9Q3U0M1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trappc9Q3U0M1 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trappc9Q3U0M1 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Trappc9Q3U0M1 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trappc9Q3U0M1 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trappc9Q3U0M1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trappc9Q3U0M1 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trappc9Q3U0M1 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trappc9Q3U0M1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trappc9Q3U0M1 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trappc9Q3U0M1 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Trappc9Q3U0M1 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trappc9Q3U0M1 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trappc9Q3U0M1 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trappc9Q3U0M1 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trappc9Q3U0M1 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trappc9Q3U0M1 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trappc9Q3U0M1 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trappc9Q3U0M1 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Trappc9Q3U0M1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Trappc9Q3U0M1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Trappc9Q3U0M1 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Trappc9Q3U0M1 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Trappc9Q3U0M1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Trappc9Q3U0M1 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Trappc9Q3U0M1 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Trappc9Q3U0M1 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Trappc9Q3U0M1 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Trappc9Q3U0M1 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Trappc9Q3U0M1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Trappc9Q3U0M1 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Trappc9Q3U0M1 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Trappc9Q3U0M1 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Trappc9Q3U0M1 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Trappc9Q3U0M1 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Trappc9Q3U0M1 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Trappc9Q3U0M1 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Trappc9Q3U0M1 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Trappc9Q3U0M1 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Trappc9Q3U0M1 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Trappc9Q3U0M1 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Trappc9Q3U0M1 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Trappc9Q3U0M1 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Trappc9Q3U0M1 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Trappc9Q3U0M1 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Trappc9Q3U0M1 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Trappc9Q3U0M1 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Trappc9Q3U0M1 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Trappc9Q3U0M1 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Trappc9Q3U0M1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Trappc9Q3U0M1 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Trappc9Q3U0M1 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Trappc9Q3U0M1 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Trappc9Q3U0M1 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Trappc9Q3U0M1 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Trappc9Q3U0M1 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Trappc9Q3U0M1 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Trappc9Q3U0M1 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Trappc9Q3U0M1 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Trappc9Q3U0M1 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Trappc9Q3U0M1 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Trappc9Q3U0M1 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms