Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYX2

Lrrn4cl, LRRN4 C-terminal-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn4clQ3TYX2 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrrn4clQ3TYX2 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrrn4clQ3TYX2 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrrn4clQ3TYX2 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrrn4clQ3TYX2 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrrn4clQ3TYX2 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrn4clQ3TYX2 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrn4clQ3TYX2 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrn4clQ3TYX2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrn4clQ3TYX2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrn4clQ3TYX2 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrn4clQ3TYX2 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrn4clQ3TYX2 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrn4clQ3TYX2 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrn4clQ3TYX2 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrn4clQ3TYX2 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrn4clQ3TYX2 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrn4clQ3TYX2 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrn4clQ3TYX2 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lrrn4clQ3TYX2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrrn4clQ3TYX2 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrrn4clQ3TYX2 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrrn4clQ3TYX2 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrrn4clQ3TYX2 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrrn4clQ3TYX2 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrrn4clQ3TYX2 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrrn4clQ3TYX2 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrrn4clQ3TYX2 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrn4clQ3TYX2 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrn4clQ3TYX2 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrn4clQ3TYX2 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrn4clQ3TYX2 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrn4clQ3TYX2 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrn4clQ3TYX2 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrn4clQ3TYX2 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrn4clQ3TYX2 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrn4clQ3TYX2 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrn4clQ3TYX2 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrn4clQ3TYX2 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrn4clQ3TYX2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrn4clQ3TYX2 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrn4clQ3TYX2 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrn4clQ3TYX2 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrn4clQ3TYX2 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrn4clQ3TYX2 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrn4clQ3TYX2 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrn4clQ3TYX2 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrn4clQ3TYX2 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrn4clQ3TYX2 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrn4clQ3TYX2 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrn4clQ3TYX2 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrn4clQ3TYX2 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrn4clQ3TYX2 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrn4clQ3TYX2 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrn4clQ3TYX2 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrn4clQ3TYX2 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrn4clQ3TYX2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrn4clQ3TYX2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrn4clQ3TYX2 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrn4clQ3TYX2 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrn4clQ3TYX2 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrn4clQ3TYX2 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrn4clQ3TYX2 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrn4clQ3TYX2 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrn4clQ3TYX2 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrn4clQ3TYX2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrn4clQ3TYX2 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrn4clQ3TYX2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrn4clQ3TYX2 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrn4clQ3TYX2 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrn4clQ3TYX2 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrn4clQ3TYX2 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrn4clQ3TYX2 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrn4clQ3TYX2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrn4clQ3TYX2 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrn4clQ3TYX2 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrn4clQ3TYX2 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrn4clQ3TYX2 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrn4clQ3TYX2 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrn4clQ3TYX2 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrn4clQ3TYX2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrn4clQ3TYX2 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrn4clQ3TYX2 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrn4clQ3TYX2 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrn4clQ3TYX2 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrn4clQ3TYX2 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrn4clQ3TYX2 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrn4clQ3TYX2 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrn4clQ3TYX2 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrn4clQ3TYX2 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrn4clQ3TYX2 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrn4clQ3TYX2 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrrn4clQ3TYX2 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrrn4clQ3TYX2 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrrn4clQ3TYX2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrrn4clQ3TYX2 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrrn4clQ3TYX2 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lrrn4clQ3TYX2 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Lrrn4clQ3TYX2 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lrrn4clQ3TYX2 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms