Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYP4

Tmem88b, Transmembrane protein 88B, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem88bQ3TYP4 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem88bQ3TYP4 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem88bQ3TYP4 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem88bQ3TYP4 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem88bQ3TYP4 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem88bQ3TYP4 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem88bQ3TYP4 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem88bQ3TYP4 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Tmem88bQ3TYP4 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem88bQ3TYP4 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem88bQ3TYP4 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem88bQ3TYP4 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem88bQ3TYP4 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem88bQ3TYP4 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem88bQ3TYP4 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem88bQ3TYP4 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem88bQ3TYP4 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem88bQ3TYP4 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem88bQ3TYP4 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem88bQ3TYP4 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem88bQ3TYP4 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem88bQ3TYP4 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem88bQ3TYP4 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem88bQ3TYP4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem88bQ3TYP4 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem88bQ3TYP4 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem88bQ3TYP4 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem88bQ3TYP4 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem88bQ3TYP4 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem88bQ3TYP4 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem88bQ3TYP4 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem88bQ3TYP4 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem88bQ3TYP4 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem88bQ3TYP4 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem88bQ3TYP4 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem88bQ3TYP4 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem88bQ3TYP4 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem88bQ3TYP4 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem88bQ3TYP4 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem88bQ3TYP4 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem88bQ3TYP4 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem88bQ3TYP4 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem88bQ3TYP4 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem88bQ3TYP4 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem88bQ3TYP4 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem88bQ3TYP4 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem88bQ3TYP4 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem88bQ3TYP4 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem88bQ3TYP4 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem88bQ3TYP4 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem88bQ3TYP4 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem88bQ3TYP4 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem88bQ3TYP4 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem88bQ3TYP4 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem88bQ3TYP4 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem88bQ3TYP4 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem88bQ3TYP4 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem88bQ3TYP4 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem88bQ3TYP4 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem88bQ3TYP4 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem88bQ3TYP4 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem88bQ3TYP4 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem88bQ3TYP4 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem88bQ3TYP4 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem88bQ3TYP4 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem88bQ3TYP4 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem88bQ3TYP4 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem88bQ3TYP4 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem88bQ3TYP4 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem88bQ3TYP4 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem88bQ3TYP4 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem88bQ3TYP4 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem88bQ3TYP4 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem88bQ3TYP4 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem88bQ3TYP4 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem88bQ3TYP4 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem88bQ3TYP4 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem88bQ3TYP4 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem88bQ3TYP4 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem88bQ3TYP4 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem88bQ3TYP4 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem88bQ3TYP4 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem88bQ3TYP4 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem88bQ3TYP4 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem88bQ3TYP4 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem88bQ3TYP4 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem88bQ3TYP4 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem88bQ3TYP4 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem88bQ3TYP4 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem88bQ3TYP4 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem88bQ3TYP4 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem88bQ3TYP4 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem88bQ3TYP4 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem88bQ3TYP4 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem88bQ3TYP4 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem88bQ3TYP4 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem88bQ3TYP4 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem88bQ3TYP4 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem88bQ3TYP4 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem88bQ3TYP4 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms