Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTY5

Krt2, Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt2Q3TTY5 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt2Q3TTY5 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt2Q3TTY5 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt2Q3TTY5 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt2Q3TTY5 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt2Q3TTY5 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt2Q3TTY5 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt2Q3TTY5 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt2Q3TTY5 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt2Q3TTY5 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt2Q3TTY5 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt2Q3TTY5 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt2Q3TTY5 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt2Q3TTY5 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt2Q3TTY5 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt2Q3TTY5 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt2Q3TTY5 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt2Q3TTY5 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt2Q3TTY5 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt2Q3TTY5 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt2Q3TTY5 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt2Q3TTY5 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt2Q3TTY5 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt2Q3TTY5 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt2Q3TTY5 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt2Q3TTY5 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt2Q3TTY5 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt2Q3TTY5 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt2Q3TTY5 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt2Q3TTY5 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt2Q3TTY5 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt2Q3TTY5 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt2Q3TTY5 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt2Q3TTY5 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt2Q3TTY5 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt2Q3TTY5 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt2Q3TTY5 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt2Q3TTY5 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt2Q3TTY5 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt2Q3TTY5 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt2Q3TTY5 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt2Q3TTY5 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt2Q3TTY5 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt2Q3TTY5 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt2Q3TTY5 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt2Q3TTY5 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt2Q3TTY5 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt2Q3TTY5 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt2Q3TTY5 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt2Q3TTY5 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt2Q3TTY5 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt2Q3TTY5 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt2Q3TTY5 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt2Q3TTY5 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt2Q3TTY5 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt2Q3TTY5 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt2Q3TTY5 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt2Q3TTY5 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt2Q3TTY5 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt2Q3TTY5 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt2Q3TTY5 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt2Q3TTY5 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt2Q3TTY5 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt2Q3TTY5 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt2Q3TTY5 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt2Q3TTY5 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt2Q3TTY5 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt2Q3TTY5 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt2Q3TTY5 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt2Q3TTY5 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt2Q3TTY5 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt2Q3TTY5 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt2Q3TTY5 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt2Q3TTY5 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt2Q3TTY5 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt2Q3TTY5 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt2Q3TTY5 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt2Q3TTY5 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt2Q3TTY5 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt2Q3TTY5 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt2Q3TTY5 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Krt2Q3TTY5 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Krt2Q3TTY5 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt2Q3TTY5 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt2Q3TTY5 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt2Q3TTY5 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt2Q3TTY5 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt2Q3TTY5 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt2Q3TTY5 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt2Q3TTY5 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt2Q3TTY5 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt2Q3TTY5 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt2Q3TTY5 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt2Q3TTY5 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt2Q3TTY5 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt2Q3TTY5 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt2Q3TTY5 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt2Q3TTY5 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt2Q3TTY5 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt2Q3TTY5 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms