Protein–RNA interactions for Protein: Q3TRM4

Pnpla6, Neuropathy target esterase, mousemouse

Predictions only

Length 1,355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnpla6Q3TRM4 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pnpla6Q3TRM4 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pnpla6Q3TRM4 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pnpla6Q3TRM4 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pnpla6Q3TRM4 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pnpla6Q3TRM4 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pnpla6Q3TRM4 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pnpla6Q3TRM4 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Pnpla6Q3TRM4 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pnpla6Q3TRM4 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pnpla6Q3TRM4 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pnpla6Q3TRM4 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pnpla6Q3TRM4 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Pnpla6Q3TRM4 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pnpla6Q3TRM4 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pnpla6Q3TRM4 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pnpla6Q3TRM4 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pnpla6Q3TRM4 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pnpla6Q3TRM4 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pnpla6Q3TRM4 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pnpla6Q3TRM4 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pnpla6Q3TRM4 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pnpla6Q3TRM4 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Pnpla6Q3TRM4 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pnpla6Q3TRM4 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pnpla6Q3TRM4 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pnpla6Q3TRM4 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pnpla6Q3TRM4 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pnpla6Q3TRM4 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pnpla6Q3TRM4 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pnpla6Q3TRM4 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pnpla6Q3TRM4 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pnpla6Q3TRM4 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pnpla6Q3TRM4 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pnpla6Q3TRM4 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Pnpla6Q3TRM4 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pnpla6Q3TRM4 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Pnpla6Q3TRM4 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pnpla6Q3TRM4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pnpla6Q3TRM4 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pnpla6Q3TRM4 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pnpla6Q3TRM4 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pnpla6Q3TRM4 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pnpla6Q3TRM4 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Pnpla6Q3TRM4 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pnpla6Q3TRM4 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pnpla6Q3TRM4 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pnpla6Q3TRM4 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pnpla6Q3TRM4 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pnpla6Q3TRM4 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pnpla6Q3TRM4 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pnpla6Q3TRM4 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pnpla6Q3TRM4 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pnpla6Q3TRM4 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pnpla6Q3TRM4 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pnpla6Q3TRM4 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pnpla6Q3TRM4 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pnpla6Q3TRM4 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pnpla6Q3TRM4 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pnpla6Q3TRM4 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pnpla6Q3TRM4 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Pnpla6Q3TRM4 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pnpla6Q3TRM4 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Pnpla6Q3TRM4 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pnpla6Q3TRM4 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pnpla6Q3TRM4 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pnpla6Q3TRM4 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pnpla6Q3TRM4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pnpla6Q3TRM4 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pnpla6Q3TRM4 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pnpla6Q3TRM4 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pnpla6Q3TRM4 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pnpla6Q3TRM4 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pnpla6Q3TRM4 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pnpla6Q3TRM4 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pnpla6Q3TRM4 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pnpla6Q3TRM4 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pnpla6Q3TRM4 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pnpla6Q3TRM4 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pnpla6Q3TRM4 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pnpla6Q3TRM4 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pnpla6Q3TRM4 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Pnpla6Q3TRM4 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pnpla6Q3TRM4 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pnpla6Q3TRM4 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pnpla6Q3TRM4 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pnpla6Q3TRM4 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pnpla6Q3TRM4 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pnpla6Q3TRM4 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pnpla6Q3TRM4 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pnpla6Q3TRM4 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pnpla6Q3TRM4 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pnpla6Q3TRM4 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pnpla6Q3TRM4 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pnpla6Q3TRM4 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pnpla6Q3TRM4 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pnpla6Q3TRM4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pnpla6Q3TRM4 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pnpla6Q3TRM4 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pnpla6Q3TRM4 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms