Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gtf3c3Q3TMP1 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Gtf3c3Q3TMP1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gtf3c3Q3TMP1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gtf3c3Q3TMP1 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gtf3c3Q3TMP1 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gtf3c3Q3TMP1 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gtf3c3Q3TMP1 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gtf3c3Q3TMP1 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gtf3c3Q3TMP1 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gtf3c3Q3TMP1 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gtf3c3Q3TMP1 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gtf3c3Q3TMP1 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gtf3c3Q3TMP1 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gtf3c3Q3TMP1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gtf3c3Q3TMP1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gtf3c3Q3TMP1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gtf3c3Q3TMP1 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gtf3c3Q3TMP1 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gtf3c3Q3TMP1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Gtf3c3Q3TMP1 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gtf3c3Q3TMP1 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gtf3c3Q3TMP1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gtf3c3Q3TMP1 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gtf3c3Q3TMP1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gtf3c3Q3TMP1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gtf3c3Q3TMP1 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gtf3c3Q3TMP1 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gtf3c3Q3TMP1 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gtf3c3Q3TMP1 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Gtf3c3Q3TMP1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gtf3c3Q3TMP1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gtf3c3Q3TMP1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gtf3c3Q3TMP1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gtf3c3Q3TMP1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gtf3c3Q3TMP1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gtf3c3Q3TMP1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gtf3c3Q3TMP1 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gtf3c3Q3TMP1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gtf3c3Q3TMP1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Gtf3c3Q3TMP1 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gtf3c3Q3TMP1 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Gtf3c3Q3TMP1 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gtf3c3Q3TMP1 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gtf3c3Q3TMP1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gtf3c3Q3TMP1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gtf3c3Q3TMP1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gtf3c3Q3TMP1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Gtf3c3Q3TMP1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Gtf3c3Q3TMP1 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gtf3c3Q3TMP1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gtf3c3Q3TMP1 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gtf3c3Q3TMP1 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gtf3c3Q3TMP1 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gtf3c3Q3TMP1 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gtf3c3Q3TMP1 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gtf3c3Q3TMP1 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gtf3c3Q3TMP1 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gtf3c3Q3TMP1 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gtf3c3Q3TMP1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gtf3c3Q3TMP1 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gtf3c3Q3TMP1 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gtf3c3Q3TMP1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gtf3c3Q3TMP1 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gtf3c3Q3TMP1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gtf3c3Q3TMP1 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gtf3c3Q3TMP1 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gtf3c3Q3TMP1 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gtf3c3Q3TMP1 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gtf3c3Q3TMP1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gtf3c3Q3TMP1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Gtf3c3Q3TMP1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gtf3c3Q3TMP1 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gtf3c3Q3TMP1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gtf3c3Q3TMP1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gtf3c3Q3TMP1 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gtf3c3Q3TMP1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gtf3c3Q3TMP1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gtf3c3Q3TMP1 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gtf3c3Q3TMP1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gtf3c3Q3TMP1 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gtf3c3Q3TMP1 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gtf3c3Q3TMP1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gtf3c3Q3TMP1 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gtf3c3Q3TMP1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gtf3c3Q3TMP1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gtf3c3Q3TMP1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gtf3c3Q3TMP1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gtf3c3Q3TMP1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gtf3c3Q3TMP1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gtf3c3Q3TMP1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Gtf3c3Q3TMP1 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gtf3c3Q3TMP1 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gtf3c3Q3TMP1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gtf3c3Q3TMP1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gtf3c3Q3TMP1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gtf3c3Q3TMP1 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gtf3c3Q3TMP1 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms