Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKT4

Smarca4, Transcription activator BRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca4Q3TKT4 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Smarca4Q3TKT4 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Smarca4Q3TKT4 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC33.66■■■□□ 2.98
Smarca4Q3TKT4 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
Smarca4Q3TKT4 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Smarca4Q3TKT4 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Smarca4Q3TKT4 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Smarca4Q3TKT4 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Smarca4Q3TKT4 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Smarca4Q3TKT4 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Smarca4Q3TKT4 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Smarca4Q3TKT4 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Smarca4Q3TKT4 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Smarca4Q3TKT4 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Smarca4Q3TKT4 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Smarca4Q3TKT4 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Smarca4Q3TKT4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Smarca4Q3TKT4 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Smarca4Q3TKT4 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Smarca4Q3TKT4 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Smarca4Q3TKT4 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
Smarca4Q3TKT4 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Smarca4Q3TKT4 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Smarca4Q3TKT4 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Smarca4Q3TKT4 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
Smarca4Q3TKT4 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
Smarca4Q3TKT4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Smarca4Q3TKT4 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Smarca4Q3TKT4 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Smarca4Q3TKT4 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Smarca4Q3TKT4 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Smarca4Q3TKT4 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Smarca4Q3TKT4 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Smarca4Q3TKT4 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
Smarca4Q3TKT4 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Smarca4Q3TKT4 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Smarca4Q3TKT4 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Smarca4Q3TKT4 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
Smarca4Q3TKT4 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Smarca4Q3TKT4 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Smarca4Q3TKT4 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Smarca4Q3TKT4 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Smarca4Q3TKT4 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Smarca4Q3TKT4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Smarca4Q3TKT4 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
Smarca4Q3TKT4 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Smarca4Q3TKT4 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Smarca4Q3TKT4 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Smarca4Q3TKT4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Smarca4Q3TKT4 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Smarca4Q3TKT4 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Smarca4Q3TKT4 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Smarca4Q3TKT4 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
Smarca4Q3TKT4 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Smarca4Q3TKT4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Smarca4Q3TKT4 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Smarca4Q3TKT4 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Smarca4Q3TKT4 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Smarca4Q3TKT4 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
Smarca4Q3TKT4 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
Smarca4Q3TKT4 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
Smarca4Q3TKT4 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
Smarca4Q3TKT4 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
Smarca4Q3TKT4 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Smarca4Q3TKT4 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
Smarca4Q3TKT4 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
Smarca4Q3TKT4 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC33.57■■■□□ 2.96
Smarca4Q3TKT4 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Smarca4Q3TKT4 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Smarca4Q3TKT4 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Smarca4Q3TKT4 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
Smarca4Q3TKT4 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Smarca4Q3TKT4 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
Smarca4Q3TKT4 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Smarca4Q3TKT4 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Smarca4Q3TKT4 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Smarca4Q3TKT4 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Smarca4Q3TKT4 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Smarca4Q3TKT4 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Smarca4Q3TKT4 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Smarca4Q3TKT4 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Smarca4Q3TKT4 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Smarca4Q3TKT4 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Smarca4Q3TKT4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Smarca4Q3TKT4 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Smarca4Q3TKT4 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Smarca4Q3TKT4 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
Smarca4Q3TKT4 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Smarca4Q3TKT4 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC33.52■■■□□ 2.96
Smarca4Q3TKT4 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Smarca4Q3TKT4 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
Smarca4Q3TKT4 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
Smarca4Q3TKT4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Smarca4Q3TKT4 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Smarca4Q3TKT4 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Smarca4Q3TKT4 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Smarca4Q3TKT4 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
Smarca4Q3TKT4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Smarca4Q3TKT4 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Smarca4Q3TKT4 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms