Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trappc13Q3TIR1 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trappc13Q3TIR1 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trappc13Q3TIR1 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Trappc13Q3TIR1 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trappc13Q3TIR1 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trappc13Q3TIR1 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trappc13Q3TIR1 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc13Q3TIR1 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc13Q3TIR1 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc13Q3TIR1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc13Q3TIR1 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc13Q3TIR1 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc13Q3TIR1 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc13Q3TIR1 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc13Q3TIR1 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc13Q3TIR1 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc13Q3TIR1 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc13Q3TIR1 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc13Q3TIR1 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc13Q3TIR1 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc13Q3TIR1 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc13Q3TIR1 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc13Q3TIR1 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc13Q3TIR1 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc13Q3TIR1 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc13Q3TIR1 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc13Q3TIR1 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc13Q3TIR1 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc13Q3TIR1 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc13Q3TIR1 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc13Q3TIR1 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc13Q3TIR1 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc13Q3TIR1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc13Q3TIR1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc13Q3TIR1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc13Q3TIR1 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc13Q3TIR1 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc13Q3TIR1 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc13Q3TIR1 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc13Q3TIR1 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc13Q3TIR1 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc13Q3TIR1 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc13Q3TIR1 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc13Q3TIR1 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc13Q3TIR1 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc13Q3TIR1 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc13Q3TIR1 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc13Q3TIR1 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc13Q3TIR1 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc13Q3TIR1 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc13Q3TIR1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc13Q3TIR1 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc13Q3TIR1 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc13Q3TIR1 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc13Q3TIR1 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc13Q3TIR1 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc13Q3TIR1 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc13Q3TIR1 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc13Q3TIR1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc13Q3TIR1 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc13Q3TIR1 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc13Q3TIR1 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc13Q3TIR1 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc13Q3TIR1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc13Q3TIR1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc13Q3TIR1 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc13Q3TIR1 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc13Q3TIR1 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc13Q3TIR1 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc13Q3TIR1 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc13Q3TIR1 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc13Q3TIR1 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc13Q3TIR1 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc13Q3TIR1 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc13Q3TIR1 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc13Q3TIR1 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc13Q3TIR1 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc13Q3TIR1 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc13Q3TIR1 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc13Q3TIR1 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc13Q3TIR1 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc13Q3TIR1 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc13Q3TIR1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc13Q3TIR1 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc13Q3TIR1 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc13Q3TIR1 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc13Q3TIR1 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc13Q3TIR1 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc13Q3TIR1 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc13Q3TIR1 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc13Q3TIR1 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc13Q3TIR1 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc13Q3TIR1 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc13Q3TIR1 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trappc13Q3TIR1 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trappc13Q3TIR1 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trappc13Q3TIR1 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trappc13Q3TIR1 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trappc13Q3TIR1 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.8 ms