Protein–RNA interactions for Protein: Q3TDQ1

Stt3b, Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit STT3B, mousemouse

Predictions only

Length 823 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stt3bQ3TDQ1 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Stt3bQ3TDQ1 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Stt3bQ3TDQ1 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Stt3bQ3TDQ1 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Stt3bQ3TDQ1 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Stt3bQ3TDQ1 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Stt3bQ3TDQ1 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Stt3bQ3TDQ1 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Stt3bQ3TDQ1 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Stt3bQ3TDQ1 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Stt3bQ3TDQ1 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Stt3bQ3TDQ1 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Stt3bQ3TDQ1 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Stt3bQ3TDQ1 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Stt3bQ3TDQ1 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Stt3bQ3TDQ1 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Stt3bQ3TDQ1 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Stt3bQ3TDQ1 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Stt3bQ3TDQ1 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Stt3bQ3TDQ1 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Stt3bQ3TDQ1 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Stt3bQ3TDQ1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Stt3bQ3TDQ1 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Stt3bQ3TDQ1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Stt3bQ3TDQ1 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Stt3bQ3TDQ1 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Stt3bQ3TDQ1 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Stt3bQ3TDQ1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Stt3bQ3TDQ1 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Stt3bQ3TDQ1 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Stt3bQ3TDQ1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Stt3bQ3TDQ1 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Stt3bQ3TDQ1 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Stt3bQ3TDQ1 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Stt3bQ3TDQ1 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Stt3bQ3TDQ1 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Stt3bQ3TDQ1 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Stt3bQ3TDQ1 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Stt3bQ3TDQ1 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Stt3bQ3TDQ1 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Stt3bQ3TDQ1 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Stt3bQ3TDQ1 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Stt3bQ3TDQ1 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Stt3bQ3TDQ1 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Stt3bQ3TDQ1 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Stt3bQ3TDQ1 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Stt3bQ3TDQ1 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Stt3bQ3TDQ1 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Stt3bQ3TDQ1 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Stt3bQ3TDQ1 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Stt3bQ3TDQ1 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Stt3bQ3TDQ1 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Stt3bQ3TDQ1 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Stt3bQ3TDQ1 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Stt3bQ3TDQ1 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Stt3bQ3TDQ1 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Stt3bQ3TDQ1 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Stt3bQ3TDQ1 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Stt3bQ3TDQ1 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Stt3bQ3TDQ1 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Stt3bQ3TDQ1 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Stt3bQ3TDQ1 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Stt3bQ3TDQ1 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Stt3bQ3TDQ1 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Stt3bQ3TDQ1 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Stt3bQ3TDQ1 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Stt3bQ3TDQ1 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Stt3bQ3TDQ1 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Stt3bQ3TDQ1 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Stt3bQ3TDQ1 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Stt3bQ3TDQ1 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Stt3bQ3TDQ1 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Stt3bQ3TDQ1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Stt3bQ3TDQ1 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Stt3bQ3TDQ1 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Stt3bQ3TDQ1 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Stt3bQ3TDQ1 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Stt3bQ3TDQ1 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Stt3bQ3TDQ1 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Stt3bQ3TDQ1 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Stt3bQ3TDQ1 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Stt3bQ3TDQ1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Stt3bQ3TDQ1 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Stt3bQ3TDQ1 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Stt3bQ3TDQ1 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Stt3bQ3TDQ1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Stt3bQ3TDQ1 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Stt3bQ3TDQ1 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Stt3bQ3TDQ1 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Stt3bQ3TDQ1 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Stt3bQ3TDQ1 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Stt3bQ3TDQ1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Stt3bQ3TDQ1 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Stt3bQ3TDQ1 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Stt3bQ3TDQ1 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Stt3bQ3TDQ1 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Stt3bQ3TDQ1 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Stt3bQ3TDQ1 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Stt3bQ3TDQ1 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Stt3bQ3TDQ1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms