Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCH7

Cul4a, Cullin-4A, mousemouse

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul4aQ3TCH7 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cul4aQ3TCH7 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cul4aQ3TCH7 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cul4aQ3TCH7 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cul4aQ3TCH7 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cul4aQ3TCH7 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cul4aQ3TCH7 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cul4aQ3TCH7 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Cul4aQ3TCH7 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cul4aQ3TCH7 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cul4aQ3TCH7 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cul4aQ3TCH7 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cul4aQ3TCH7 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cul4aQ3TCH7 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Cul4aQ3TCH7 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Cul4aQ3TCH7 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Cul4aQ3TCH7 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cul4aQ3TCH7 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cul4aQ3TCH7 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cul4aQ3TCH7 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cul4aQ3TCH7 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cul4aQ3TCH7 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cul4aQ3TCH7 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cul4aQ3TCH7 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cul4aQ3TCH7 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cul4aQ3TCH7 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cul4aQ3TCH7 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cul4aQ3TCH7 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cul4aQ3TCH7 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cul4aQ3TCH7 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cul4aQ3TCH7 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cul4aQ3TCH7 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cul4aQ3TCH7 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cul4aQ3TCH7 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cul4aQ3TCH7 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cul4aQ3TCH7 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cul4aQ3TCH7 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cul4aQ3TCH7 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cul4aQ3TCH7 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cul4aQ3TCH7 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cul4aQ3TCH7 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cul4aQ3TCH7 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cul4aQ3TCH7 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cul4aQ3TCH7 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cul4aQ3TCH7 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cul4aQ3TCH7 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cul4aQ3TCH7 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cul4aQ3TCH7 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cul4aQ3TCH7 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cul4aQ3TCH7 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cul4aQ3TCH7 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cul4aQ3TCH7 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cul4aQ3TCH7 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Cul4aQ3TCH7 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cul4aQ3TCH7 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cul4aQ3TCH7 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cul4aQ3TCH7 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cul4aQ3TCH7 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cul4aQ3TCH7 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cul4aQ3TCH7 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cul4aQ3TCH7 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cul4aQ3TCH7 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cul4aQ3TCH7 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cul4aQ3TCH7 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cul4aQ3TCH7 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cul4aQ3TCH7 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cul4aQ3TCH7 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cul4aQ3TCH7 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cul4aQ3TCH7 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cul4aQ3TCH7 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cul4aQ3TCH7 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cul4aQ3TCH7 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Cul4aQ3TCH7 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cul4aQ3TCH7 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cul4aQ3TCH7 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cul4aQ3TCH7 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cul4aQ3TCH7 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cul4aQ3TCH7 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cul4aQ3TCH7 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cul4aQ3TCH7 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cul4aQ3TCH7 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cul4aQ3TCH7 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cul4aQ3TCH7 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cul4aQ3TCH7 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cul4aQ3TCH7 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cul4aQ3TCH7 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cul4aQ3TCH7 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cul4aQ3TCH7 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cul4aQ3TCH7 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cul4aQ3TCH7 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cul4aQ3TCH7 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cul4aQ3TCH7 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cul4aQ3TCH7 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cul4aQ3TCH7 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cul4aQ3TCH7 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cul4aQ3TCH7 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cul4aQ3TCH7 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cul4aQ3TCH7 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cul4aQ3TCH7 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cul4aQ3TCH7 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
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