Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKI2

Vax1, Ventral anterior homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vax1Q2NKI2 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vax1Q2NKI2 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vax1Q2NKI2 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vax1Q2NKI2 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vax1Q2NKI2 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vax1Q2NKI2 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vax1Q2NKI2 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vax1Q2NKI2 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vax1Q2NKI2 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vax1Q2NKI2 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vax1Q2NKI2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vax1Q2NKI2 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vax1Q2NKI2 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vax1Q2NKI2 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vax1Q2NKI2 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vax1Q2NKI2 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vax1Q2NKI2 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vax1Q2NKI2 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vax1Q2NKI2 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Vax1Q2NKI2 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Vax1Q2NKI2 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vax1Q2NKI2 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vax1Q2NKI2 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vax1Q2NKI2 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vax1Q2NKI2 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vax1Q2NKI2 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vax1Q2NKI2 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vax1Q2NKI2 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vax1Q2NKI2 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vax1Q2NKI2 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vax1Q2NKI2 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vax1Q2NKI2 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vax1Q2NKI2 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vax1Q2NKI2 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vax1Q2NKI2 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vax1Q2NKI2 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Vax1Q2NKI2 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vax1Q2NKI2 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vax1Q2NKI2 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vax1Q2NKI2 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vax1Q2NKI2 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vax1Q2NKI2 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vax1Q2NKI2 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vax1Q2NKI2 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vax1Q2NKI2 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vax1Q2NKI2 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vax1Q2NKI2 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vax1Q2NKI2 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vax1Q2NKI2 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vax1Q2NKI2 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Vax1Q2NKI2 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vax1Q2NKI2 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Vax1Q2NKI2 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vax1Q2NKI2 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vax1Q2NKI2 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vax1Q2NKI2 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vax1Q2NKI2 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vax1Q2NKI2 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vax1Q2NKI2 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vax1Q2NKI2 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vax1Q2NKI2 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vax1Q2NKI2 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vax1Q2NKI2 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vax1Q2NKI2 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vax1Q2NKI2 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vax1Q2NKI2 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vax1Q2NKI2 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vax1Q2NKI2 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vax1Q2NKI2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vax1Q2NKI2 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vax1Q2NKI2 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vax1Q2NKI2 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vax1Q2NKI2 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vax1Q2NKI2 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vax1Q2NKI2 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vax1Q2NKI2 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vax1Q2NKI2 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vax1Q2NKI2 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Vax1Q2NKI2 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vax1Q2NKI2 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vax1Q2NKI2 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vax1Q2NKI2 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vax1Q2NKI2 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vax1Q2NKI2 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vax1Q2NKI2 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vax1Q2NKI2 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vax1Q2NKI2 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Vax1Q2NKI2 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vax1Q2NKI2 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vax1Q2NKI2 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vax1Q2NKI2 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Vax1Q2NKI2 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Vax1Q2NKI2 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vax1Q2NKI2 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vax1Q2NKI2 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Vax1Q2NKI2 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vax1Q2NKI2 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vax1Q2NKI2 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vax1Q2NKI2 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vax1Q2NKI2 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms