Protein–RNA interactions for Protein: Q2MH31

Smrp1, Spermatid-specific manchette-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smrp1Q2MH31 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smrp1Q2MH31 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smrp1Q2MH31 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smrp1Q2MH31 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smrp1Q2MH31 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smrp1Q2MH31 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smrp1Q2MH31 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smrp1Q2MH31 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smrp1Q2MH31 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Smrp1Q2MH31 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smrp1Q2MH31 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smrp1Q2MH31 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smrp1Q2MH31 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smrp1Q2MH31 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smrp1Q2MH31 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Smrp1Q2MH31 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Smrp1Q2MH31 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Smrp1Q2MH31 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smrp1Q2MH31 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smrp1Q2MH31 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smrp1Q2MH31 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smrp1Q2MH31 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smrp1Q2MH31 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Smrp1Q2MH31 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smrp1Q2MH31 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smrp1Q2MH31 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Smrp1Q2MH31 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smrp1Q2MH31 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smrp1Q2MH31 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smrp1Q2MH31 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smrp1Q2MH31 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smrp1Q2MH31 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smrp1Q2MH31 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smrp1Q2MH31 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smrp1Q2MH31 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smrp1Q2MH31 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Smrp1Q2MH31 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smrp1Q2MH31 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smrp1Q2MH31 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smrp1Q2MH31 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smrp1Q2MH31 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smrp1Q2MH31 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smrp1Q2MH31 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smrp1Q2MH31 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smrp1Q2MH31 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smrp1Q2MH31 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smrp1Q2MH31 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smrp1Q2MH31 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smrp1Q2MH31 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Smrp1Q2MH31 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smrp1Q2MH31 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smrp1Q2MH31 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smrp1Q2MH31 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smrp1Q2MH31 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smrp1Q2MH31 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smrp1Q2MH31 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smrp1Q2MH31 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smrp1Q2MH31 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smrp1Q2MH31 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smrp1Q2MH31 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smrp1Q2MH31 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smrp1Q2MH31 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smrp1Q2MH31 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smrp1Q2MH31 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smrp1Q2MH31 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smrp1Q2MH31 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smrp1Q2MH31 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smrp1Q2MH31 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smrp1Q2MH31 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smrp1Q2MH31 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smrp1Q2MH31 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smrp1Q2MH31 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smrp1Q2MH31 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smrp1Q2MH31 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smrp1Q2MH31 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smrp1Q2MH31 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Smrp1Q2MH31 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smrp1Q2MH31 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smrp1Q2MH31 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smrp1Q2MH31 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smrp1Q2MH31 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smrp1Q2MH31 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smrp1Q2MH31 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smrp1Q2MH31 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smrp1Q2MH31 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smrp1Q2MH31 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smrp1Q2MH31 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smrp1Q2MH31 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smrp1Q2MH31 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smrp1Q2MH31 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smrp1Q2MH31 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smrp1Q2MH31 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smrp1Q2MH31 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smrp1Q2MH31 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smrp1Q2MH31 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smrp1Q2MH31 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smrp1Q2MH31 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smrp1Q2MH31 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smrp1Q2MH31 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smrp1Q2MH31 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms