Protein–RNA interactions for Protein: Q1EG27

Myo3b, Myosin-IIIb, mousemouse

Predictions only

Length 1,305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo3bQ1EG27 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Myo3bQ1EG27 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Myo3bQ1EG27 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Myo3bQ1EG27 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Myo3bQ1EG27 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Myo3bQ1EG27 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Myo3bQ1EG27 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Myo3bQ1EG27 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Myo3bQ1EG27 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Myo3bQ1EG27 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Myo3bQ1EG27 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Myo3bQ1EG27 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Myo3bQ1EG27 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Myo3bQ1EG27 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Myo3bQ1EG27 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Myo3bQ1EG27 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Myo3bQ1EG27 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Myo3bQ1EG27 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Myo3bQ1EG27 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Myo3bQ1EG27 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Myo3bQ1EG27 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Myo3bQ1EG27 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Myo3bQ1EG27 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Myo3bQ1EG27 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Myo3bQ1EG27 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Myo3bQ1EG27 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Myo3bQ1EG27 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Myo3bQ1EG27 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Myo3bQ1EG27 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Myo3bQ1EG27 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Myo3bQ1EG27 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Myo3bQ1EG27 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Myo3bQ1EG27 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Myo3bQ1EG27 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Myo3bQ1EG27 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Myo3bQ1EG27 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Myo3bQ1EG27 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Myo3bQ1EG27 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Myo3bQ1EG27 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Myo3bQ1EG27 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Myo3bQ1EG27 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Myo3bQ1EG27 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Myo3bQ1EG27 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Myo3bQ1EG27 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Myo3bQ1EG27 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Myo3bQ1EG27 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Myo3bQ1EG27 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Myo3bQ1EG27 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Myo3bQ1EG27 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Myo3bQ1EG27 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Myo3bQ1EG27 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Myo3bQ1EG27 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Myo3bQ1EG27 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Myo3bQ1EG27 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Myo3bQ1EG27 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Myo3bQ1EG27 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Myo3bQ1EG27 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Myo3bQ1EG27 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Myo3bQ1EG27 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Myo3bQ1EG27 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Myo3bQ1EG27 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Myo3bQ1EG27 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Myo3bQ1EG27 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Myo3bQ1EG27 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Myo3bQ1EG27 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Myo3bQ1EG27 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Myo3bQ1EG27 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Myo3bQ1EG27 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Myo3bQ1EG27 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Myo3bQ1EG27 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Myo3bQ1EG27 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Myo3bQ1EG27 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Myo3bQ1EG27 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Myo3bQ1EG27 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Myo3bQ1EG27 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Myo3bQ1EG27 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Myo3bQ1EG27 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Myo3bQ1EG27 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Myo3bQ1EG27 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Myo3bQ1EG27 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Myo3bQ1EG27 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Myo3bQ1EG27 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Myo3bQ1EG27 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Myo3bQ1EG27 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Myo3bQ1EG27 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Myo3bQ1EG27 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Myo3bQ1EG27 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Myo3bQ1EG27 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Myo3bQ1EG27 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Myo3bQ1EG27 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Myo3bQ1EG27 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Myo3bQ1EG27 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Myo3bQ1EG27 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Myo3bQ1EG27 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Myo3bQ1EG27 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Myo3bQ1EG27 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Myo3bQ1EG27 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Myo3bQ1EG27 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Myo3bQ1EG27 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Myo3bQ1EG27 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms