Protein–RNA interactions for Protein: Q1A3B0

Cers3, Ceramide synthase 3, mousemouse

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Length 383 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cers3Q1A3B0 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cers3Q1A3B0 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cers3Q1A3B0 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cers3Q1A3B0 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cers3Q1A3B0 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cers3Q1A3B0 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cers3Q1A3B0 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cers3Q1A3B0 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cers3Q1A3B0 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cers3Q1A3B0 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cers3Q1A3B0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cers3Q1A3B0 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cers3Q1A3B0 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cers3Q1A3B0 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cers3Q1A3B0 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cers3Q1A3B0 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cers3Q1A3B0 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cers3Q1A3B0 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cers3Q1A3B0 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cers3Q1A3B0 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cers3Q1A3B0 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cers3Q1A3B0 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cers3Q1A3B0 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cers3Q1A3B0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cers3Q1A3B0 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Cers3Q1A3B0 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cers3Q1A3B0 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cers3Q1A3B0 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cers3Q1A3B0 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cers3Q1A3B0 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cers3Q1A3B0 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cers3Q1A3B0 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cers3Q1A3B0 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cers3Q1A3B0 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cers3Q1A3B0 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cers3Q1A3B0 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cers3Q1A3B0 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cers3Q1A3B0 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cers3Q1A3B0 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cers3Q1A3B0 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Cers3Q1A3B0 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cers3Q1A3B0 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cers3Q1A3B0 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cers3Q1A3B0 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Cers3Q1A3B0 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cers3Q1A3B0 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cers3Q1A3B0 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Cers3Q1A3B0 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cers3Q1A3B0 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cers3Q1A3B0 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cers3Q1A3B0 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cers3Q1A3B0 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cers3Q1A3B0 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.43
Cers3Q1A3B0 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cers3Q1A3B0 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cers3Q1A3B0 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cers3Q1A3B0 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cers3Q1A3B0 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cers3Q1A3B0 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cers3Q1A3B0 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cers3Q1A3B0 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cers3Q1A3B0 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cers3Q1A3B0 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cers3Q1A3B0 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cers3Q1A3B0 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cers3Q1A3B0 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cers3Q1A3B0 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cers3Q1A3B0 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cers3Q1A3B0 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Cers3Q1A3B0 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Cers3Q1A3B0 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cers3Q1A3B0 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cers3Q1A3B0 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cers3Q1A3B0 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cers3Q1A3B0 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cers3Q1A3B0 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cers3Q1A3B0 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cers3Q1A3B0 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cers3Q1A3B0 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cers3Q1A3B0 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cers3Q1A3B0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cers3Q1A3B0 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cers3Q1A3B0 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cers3Q1A3B0 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cers3Q1A3B0 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cers3Q1A3B0 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cers3Q1A3B0 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cers3Q1A3B0 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cers3Q1A3B0 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cers3Q1A3B0 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cers3Q1A3B0 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cers3Q1A3B0 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cers3Q1A3B0 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cers3Q1A3B0 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cers3Q1A3B0 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cers3Q1A3B0 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cers3Q1A3B0 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Cers3Q1A3B0 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cers3Q1A3B0 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cers3Q1A3B0 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
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