Protein–RNA interactions for Protein: Q14BI7

Tdrd9, ATP-dependent RNA helicase TDRD9, mousemouse

Predictions only

Length 1,383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd9Q14BI7 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
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Tdrd9Q14BI7 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Tdrd9Q14BI7 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Tdrd9Q14BI7 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Tdrd9Q14BI7 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Tdrd9Q14BI7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Tdrd9Q14BI7 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Tdrd9Q14BI7 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Tdrd9Q14BI7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Tdrd9Q14BI7 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Tdrd9Q14BI7 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Tdrd9Q14BI7 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Tdrd9Q14BI7 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Tdrd9Q14BI7 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Tdrd9Q14BI7 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Tdrd9Q14BI7 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Tdrd9Q14BI7 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Tdrd9Q14BI7 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Tdrd9Q14BI7 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Tdrd9Q14BI7 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Tdrd9Q14BI7 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Tdrd9Q14BI7 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Tdrd9Q14BI7 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Tdrd9Q14BI7 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Tdrd9Q14BI7 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Tdrd9Q14BI7 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Tdrd9Q14BI7 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Tdrd9Q14BI7 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Tdrd9Q14BI7 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Tdrd9Q14BI7 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Tdrd9Q14BI7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Tdrd9Q14BI7 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Tdrd9Q14BI7 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Tdrd9Q14BI7 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Tdrd9Q14BI7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Tdrd9Q14BI7 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Tdrd9Q14BI7 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Tdrd9Q14BI7 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Tdrd9Q14BI7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Tdrd9Q14BI7 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Tdrd9Q14BI7 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Tdrd9Q14BI7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Tdrd9Q14BI7 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Tdrd9Q14BI7 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Tdrd9Q14BI7 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Tdrd9Q14BI7 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Tdrd9Q14BI7 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Tdrd9Q14BI7 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Tdrd9Q14BI7 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Tdrd9Q14BI7 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Tdrd9Q14BI7 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Tdrd9Q14BI7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Tdrd9Q14BI7 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
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Tdrd9Q14BI7 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Tdrd9Q14BI7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Tdrd9Q14BI7 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Tdrd9Q14BI7 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Tdrd9Q14BI7 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Tdrd9Q14BI7 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Tdrd9Q14BI7 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
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Tdrd9Q14BI7 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
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Tdrd9Q14BI7 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Tdrd9Q14BI7 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Tdrd9Q14BI7 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Tdrd9Q14BI7 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
Tdrd9Q14BI7 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Tdrd9Q14BI7 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Tdrd9Q14BI7 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Tdrd9Q14BI7 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Tdrd9Q14BI7 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Tdrd9Q14BI7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Tdrd9Q14BI7 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Tdrd9Q14BI7 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Tdrd9Q14BI7 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Tdrd9Q14BI7 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Tdrd9Q14BI7 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Tdrd9Q14BI7 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Tdrd9Q14BI7 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Tdrd9Q14BI7 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Tdrd9Q14BI7 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Tdrd9Q14BI7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Tdrd9Q14BI7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Tdrd9Q14BI7 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Tdrd9Q14BI7 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Tdrd9Q14BI7 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Tdrd9Q14BI7 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Tdrd9Q14BI7 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Tdrd9Q14BI7 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Tdrd9Q14BI7 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Tdrd9Q14BI7 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Tdrd9Q14BI7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms