Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpusd3Q14AI6 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpusd3Q14AI6 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpusd3Q14AI6 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpusd3Q14AI6 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpusd3Q14AI6 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpusd3Q14AI6 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpusd3Q14AI6 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpusd3Q14AI6 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpusd3Q14AI6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpusd3Q14AI6 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpusd3Q14AI6 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpusd3Q14AI6 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpusd3Q14AI6 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpusd3Q14AI6 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpusd3Q14AI6 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpusd3Q14AI6 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpusd3Q14AI6 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpusd3Q14AI6 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpusd3Q14AI6 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpusd3Q14AI6 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpusd3Q14AI6 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpusd3Q14AI6 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpusd3Q14AI6 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpusd3Q14AI6 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpusd3Q14AI6 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpusd3Q14AI6 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpusd3Q14AI6 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpusd3Q14AI6 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpusd3Q14AI6 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpusd3Q14AI6 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpusd3Q14AI6 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpusd3Q14AI6 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpusd3Q14AI6 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpusd3Q14AI6 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpusd3Q14AI6 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpusd3Q14AI6 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpusd3Q14AI6 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpusd3Q14AI6 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpusd3Q14AI6 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rpusd3Q14AI6 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpusd3Q14AI6 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpusd3Q14AI6 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpusd3Q14AI6 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpusd3Q14AI6 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpusd3Q14AI6 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpusd3Q14AI6 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpusd3Q14AI6 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpusd3Q14AI6 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpusd3Q14AI6 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpusd3Q14AI6 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpusd3Q14AI6 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpusd3Q14AI6 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpusd3Q14AI6 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpusd3Q14AI6 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpusd3Q14AI6 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpusd3Q14AI6 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpusd3Q14AI6 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpusd3Q14AI6 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpusd3Q14AI6 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpusd3Q14AI6 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpusd3Q14AI6 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpusd3Q14AI6 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpusd3Q14AI6 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpusd3Q14AI6 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpusd3Q14AI6 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpusd3Q14AI6 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpusd3Q14AI6 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpusd3Q14AI6 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpusd3Q14AI6 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpusd3Q14AI6 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpusd3Q14AI6 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpusd3Q14AI6 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpusd3Q14AI6 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpusd3Q14AI6 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpusd3Q14AI6 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpusd3Q14AI6 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpusd3Q14AI6 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpusd3Q14AI6 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpusd3Q14AI6 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpusd3Q14AI6 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpusd3Q14AI6 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpusd3Q14AI6 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpusd3Q14AI6 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpusd3Q14AI6 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpusd3Q14AI6 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpusd3Q14AI6 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpusd3Q14AI6 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpusd3Q14AI6 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpusd3Q14AI6 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpusd3Q14AI6 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpusd3Q14AI6 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpusd3Q14AI6 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpusd3Q14AI6 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpusd3Q14AI6 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpusd3Q14AI6 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpusd3Q14AI6 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpusd3Q14AI6 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpusd3Q14AI6 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpusd3Q14AI6 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
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