Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rpusd2Q149F1 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rpusd2Q149F1 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rpusd2Q149F1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rpusd2Q149F1 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rpusd2Q149F1 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rpusd2Q149F1 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rpusd2Q149F1 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rpusd2Q149F1 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rpusd2Q149F1 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rpusd2Q149F1 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rpusd2Q149F1 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rpusd2Q149F1 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rpusd2Q149F1 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rpusd2Q149F1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Rpusd2Q149F1 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rpusd2Q149F1 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rpusd2Q149F1 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rpusd2Q149F1 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rpusd2Q149F1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rpusd2Q149F1 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rpusd2Q149F1 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rpusd2Q149F1 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Rpusd2Q149F1 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Rpusd2Q149F1 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rpusd2Q149F1 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rpusd2Q149F1 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rpusd2Q149F1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rpusd2Q149F1 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rpusd2Q149F1 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rpusd2Q149F1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rpusd2Q149F1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rpusd2Q149F1 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rpusd2Q149F1 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rpusd2Q149F1 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rpusd2Q149F1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rpusd2Q149F1 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rpusd2Q149F1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rpusd2Q149F1 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rpusd2Q149F1 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rpusd2Q149F1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rpusd2Q149F1 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rpusd2Q149F1 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rpusd2Q149F1 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rpusd2Q149F1 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rpusd2Q149F1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rpusd2Q149F1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rpusd2Q149F1 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rpusd2Q149F1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rpusd2Q149F1 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rpusd2Q149F1 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rpusd2Q149F1 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rpusd2Q149F1 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rpusd2Q149F1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rpusd2Q149F1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rpusd2Q149F1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rpusd2Q149F1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rpusd2Q149F1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rpusd2Q149F1 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rpusd2Q149F1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rpusd2Q149F1 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rpusd2Q149F1 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rpusd2Q149F1 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rpusd2Q149F1 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rpusd2Q149F1 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rpusd2Q149F1 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rpusd2Q149F1 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rpusd2Q149F1 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rpusd2Q149F1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rpusd2Q149F1 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rpusd2Q149F1 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rpusd2Q149F1 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rpusd2Q149F1 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rpusd2Q149F1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rpusd2Q149F1 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rpusd2Q149F1 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Rpusd2Q149F1 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rpusd2Q149F1 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rpusd2Q149F1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rpusd2Q149F1 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rpusd2Q149F1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rpusd2Q149F1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rpusd2Q149F1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rpusd2Q149F1 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rpusd2Q149F1 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Rpusd2Q149F1 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rpusd2Q149F1 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rpusd2Q149F1 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rpusd2Q149F1 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rpusd2Q149F1 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rpusd2Q149F1 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rpusd2Q149F1 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Rpusd2Q149F1 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rpusd2Q149F1 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rpusd2Q149F1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rpusd2Q149F1 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rpusd2Q149F1 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Rpusd2Q149F1 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rpusd2Q149F1 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rpusd2Q149F1 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms