Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc162pQ0VG85 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc162pQ0VG85 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc162pQ0VG85 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc162pQ0VG85 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc162pQ0VG85 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc162pQ0VG85 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc162pQ0VG85 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc162pQ0VG85 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc162pQ0VG85 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc162pQ0VG85 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc162pQ0VG85 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc162pQ0VG85 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc162pQ0VG85 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc162pQ0VG85 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc162pQ0VG85 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc162pQ0VG85 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc162pQ0VG85 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc162pQ0VG85 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc162pQ0VG85 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc162pQ0VG85 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc162pQ0VG85 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc162pQ0VG85 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc162pQ0VG85 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc162pQ0VG85 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc162pQ0VG85 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc162pQ0VG85 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc162pQ0VG85 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc162pQ0VG85 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc162pQ0VG85 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc162pQ0VG85 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc162pQ0VG85 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc162pQ0VG85 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc162pQ0VG85 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc162pQ0VG85 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc162pQ0VG85 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc162pQ0VG85 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc162pQ0VG85 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc162pQ0VG85 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc162pQ0VG85 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc162pQ0VG85 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc162pQ0VG85 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc162pQ0VG85 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc162pQ0VG85 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc162pQ0VG85 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc162pQ0VG85 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc162pQ0VG85 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc162pQ0VG85 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc162pQ0VG85 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc162pQ0VG85 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc162pQ0VG85 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc162pQ0VG85 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc162pQ0VG85 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc162pQ0VG85 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc162pQ0VG85 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc162pQ0VG85 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc162pQ0VG85 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc162pQ0VG85 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc162pQ0VG85 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc162pQ0VG85 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc162pQ0VG85 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc162pQ0VG85 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc162pQ0VG85 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc162pQ0VG85 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc162pQ0VG85 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc162pQ0VG85 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc162pQ0VG85 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc162pQ0VG85 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc162pQ0VG85 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc162pQ0VG85 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc162pQ0VG85 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc162pQ0VG85 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc162pQ0VG85 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc162pQ0VG85 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc162pQ0VG85 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc162pQ0VG85 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc162pQ0VG85 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc162pQ0VG85 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc162pQ0VG85 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc162pQ0VG85 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc162pQ0VG85 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc162pQ0VG85 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc162pQ0VG85 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc162pQ0VG85 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc162pQ0VG85 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc162pQ0VG85 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc162pQ0VG85 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc162pQ0VG85 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc162pQ0VG85 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc162pQ0VG85 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc162pQ0VG85 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc162pQ0VG85 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc162pQ0VG85 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc162pQ0VG85 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc162pQ0VG85 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc162pQ0VG85 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc162pQ0VG85 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc162pQ0VG85 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc162pQ0VG85 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc162pQ0VG85 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms