Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE82

Cpne7, Copine-7, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne7Q0VE82 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cpne7Q0VE82 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cpne7Q0VE82 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cpne7Q0VE82 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cpne7Q0VE82 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cpne7Q0VE82 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cpne7Q0VE82 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cpne7Q0VE82 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cpne7Q0VE82 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Cpne7Q0VE82 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cpne7Q0VE82 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cpne7Q0VE82 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cpne7Q0VE82 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cpne7Q0VE82 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cpne7Q0VE82 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cpne7Q0VE82 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Cpne7Q0VE82 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cpne7Q0VE82 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cpne7Q0VE82 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cpne7Q0VE82 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cpne7Q0VE82 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cpne7Q0VE82 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Cpne7Q0VE82 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cpne7Q0VE82 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cpne7Q0VE82 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cpne7Q0VE82 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cpne7Q0VE82 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cpne7Q0VE82 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cpne7Q0VE82 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cpne7Q0VE82 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cpne7Q0VE82 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cpne7Q0VE82 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cpne7Q0VE82 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cpne7Q0VE82 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cpne7Q0VE82 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cpne7Q0VE82 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cpne7Q0VE82 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Cpne7Q0VE82 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cpne7Q0VE82 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cpne7Q0VE82 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cpne7Q0VE82 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Cpne7Q0VE82 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cpne7Q0VE82 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Cpne7Q0VE82 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cpne7Q0VE82 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cpne7Q0VE82 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cpne7Q0VE82 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cpne7Q0VE82 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cpne7Q0VE82 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cpne7Q0VE82 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cpne7Q0VE82 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cpne7Q0VE82 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cpne7Q0VE82 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cpne7Q0VE82 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cpne7Q0VE82 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cpne7Q0VE82 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cpne7Q0VE82 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cpne7Q0VE82 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cpne7Q0VE82 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cpne7Q0VE82 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cpne7Q0VE82 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cpne7Q0VE82 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cpne7Q0VE82 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cpne7Q0VE82 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cpne7Q0VE82 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cpne7Q0VE82 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cpne7Q0VE82 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Cpne7Q0VE82 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cpne7Q0VE82 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cpne7Q0VE82 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cpne7Q0VE82 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cpne7Q0VE82 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cpne7Q0VE82 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cpne7Q0VE82 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cpne7Q0VE82 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cpne7Q0VE82 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cpne7Q0VE82 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cpne7Q0VE82 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cpne7Q0VE82 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cpne7Q0VE82 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cpne7Q0VE82 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cpne7Q0VE82 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Cpne7Q0VE82 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cpne7Q0VE82 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cpne7Q0VE82 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Cpne7Q0VE82 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cpne7Q0VE82 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cpne7Q0VE82 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cpne7Q0VE82 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Cpne7Q0VE82 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cpne7Q0VE82 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cpne7Q0VE82 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cpne7Q0VE82 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cpne7Q0VE82 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cpne7Q0VE82 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cpne7Q0VE82 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cpne7Q0VE82 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cpne7Q0VE82 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cpne7Q0VE82 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cpne7Q0VE82 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms